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Mapping path and fate diversity of molecular mechanisms of infection with smart microscopy

Descrizione del progetto

Osservare dal vivo i percorsi dell’infezione batterica

I patogeni batterici come Yersinia pseudotuberculosis devono percepire e adattarsi rapidamente alle condizioni dell’ospite per eludere le risposte immunitarie, replicarsi e instaurare l’infezione. Capire la dinamica di queste interazioni dinamiche tra ospite e agente patogeno è fondamentale per la progettazione di terapie di precisione e per affrontare la resistenza agli antibiotici. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto InfPathMapper sta lavorando a una piattaforma di microscopia a super-risoluzione (SRM) per la visualizzazione dei singoli eventi di un’infezione in tempo reale. La SRM supera i limiti di risoluzione della microscopia ottica standard e consente di visualizzare su nanoscala gli eventi molecolari all’interno delle cellule viventi. I ricercatori combineranno la SRM con l’apprendimento automatico per studiare i percorsi dell’infezione e le risposte dell’ospite, nel tentativo di ottenere informazioni preziose sull’infezione in fase iniziale.

Obiettivo

Pathogens like Yersinia pseudotuberculosis must rapidly adapt to environmental cues to progress through infection, manipulating host responses to survive and replicate. Understanding these adaptive host-pathogen interactions is key to developing targeted therapies, combating antibiotic resistance, and preventing chronic infections. However, current methods miss rare, transient infection stages, limiting our understanding of infection pathways. My project aims to address this by developing InfPathMapper, a data-driven super-resolution microscopy (SRM) platform to map infection pathways in living cells at molecular resolution.
While advances in fluorescence microscopy provide detailed molecular insights, they often struggle with phototoxicity, limited spatiotemporal resolution, and reliance on fixed samples, missing dynamic information of infection processes. My approach will extend a data-driven microscopy platform by integrating adaptive SRM modalities for live-cell imaging of Y. pseudotuberculosis infection, a pathogen with virulence mechanisms conserved across many bacteria. This system will be able to map pathways of individual infection events at super-resolution level in a live-cell fluorescence-based infection assay supported by machine learning to classify pathogen invasion stages and host cell response patterns. Live-to-fix super-resolution mapping of the molecular architecture of critical infection stages will provide new insights into how Yersinia adapts to niche-specific environments and host-induced stress. By combining cutting-edge microscopy with infection biology, the project will not only set me on an excellent pathway toward achieving research independence, it is also expected to contribute valuable knowledge and tools for the broader research community, fostering innovation in the study of other pathogens and dynamic intracellular processes and the fight against infectious diseases.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

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Coordinatore

LUNDS UNIVERSITET
Contributo netto dell'UE
€ 236 340,00
Indirizzo
Paradisgatan 5c
22100 Lund
Svezia
Regione
Södra Sverige Sydsverige Skåne län
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato