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Unravelling the impact of nucleosome arrays on condensin by implementing an in-vitro chromatin-loop extrusion assay

Descrizione del progetto

Attori molecolari della struttura cromosomica

All’interno delle nostre cellule, il DNA è strettamente arrotolato attorno a proteine chiamate istoni, formando lunghi filamenti noti come fibre di cromatina. Si ritiene che queste fibre si ripieghino ulteriormente in anse, creando alla fine i familiari cromosomi a forma di X che si vedono durante la divisione cellulare. L’organizzazione di questa intricata struttura 3D è fondamentale per la regolazione dei geni, la riparazione dei danni al DNA e la segregazione dei cromosomi. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto ConNuc studia la condensina, un complesso proteico che guida il ripiegamento delle anse della cromatina e la cui disfunzione è associata a diverse malattie. I ricercatori intendono scoprire come questo complesso acceda al DNA impacchettato all’interno dei nucleosomi, fornendo così indicazioni fondamentali sull’organizzazione del genoma e sulle sue implicazioni per la salute e le malattie.

Obiettivo

The three-dimensional organization of chromosomal DNA is essential for critical genomic functions, including chromosome segregation, gene expression, and DNA damage repair. Structural Maintenance of Chromosomes (SMC) complexes, such as cohesin, the Smc5/6 complex, and condensin, are integral to preserving chromosomal architecture and supporting these vital processes. Condensin folds DNA into mitotic chromosomes through DNA loop extrusion, a process critical for proper chromosome segregation. Recent single-molecule studies using naked DNA as template have shed light on how condensin drives DNA loop extrusion through multiple dynamic DNA-protein contacts. However, in cells, DNA is organized into nucleosomes that further compact into chromatin fibers, stabilized by linker histone H1, which restricts DNA accessibility to most DNA-binding proteins. How condensin gets access to DNA and extrudes DNA wrapped into nucleosome arrays remains unclear. Understanding how condensin operates on chromatin fibers is essential, as dysregulation of condensin activity in humans is linked to neurological disorders, cancer, and Alzheimer’s disease. This research aims to explore whether and how condensin extrudes nucleosome arrays by implementing a novel single-molecule chromatin loop extrusion assay. This project aims to (1) examine whether in-vitro-reconstituted densely packed nucleosome arrays affect condensin-mediated DNA loop extrusion; (2) study the impact of internucleosomal linker DNA length on this process; (3) assess the influence of nucleosome compaction by linker histone H1 on condensin-mediated loop extrusion; (4) investigate the enhancement of condensin-mediated DNA loop extrusion by chromatin remodellers. Insights gained from these studies have the potential to significantly advance our understanding of how the condensin complex interacts with chromatin fibers and extrudes these fibers into loops within the cellular environment.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

JULIUS-MAXIMILIANS-UNIVERSITAT WURZBURG
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 217 965,12
Indirizzo
SANDERRING 2
97070 Wuerzburg
Germania

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Regione
Bayern Unterfranken Würzburg, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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