Projektbeschreibung
Spezifische Transkriptionsfaktoren und ihre Funktion bei der Genexpression
Transkriptionsfaktoren sind Proteine, die eine entscheidende Rolle bei der Transkription von DNS in RNS übernehmen. Das Team des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts GRADMAP wird die Hypothese untersuchen, dass Transkriptionsfaktoren nicht zufällig räumlich im Zellkern organisiert sind und radiale Gradienten bilden, die für die Regulierung der Genexpression von zentraler Bedeutung sein könnten. Dabei werden hämatopoetische Stammzellen in verschiedene Abstammungslinien differenziert und es wird CUT&RUN-Sequenzierung angewandt, um zu kartieren, wo Transkriptionsfaktoren im Zeitverlauf und innerhalb des Zellkerns an die DNS binden.
Ziel
Here I propose an ambitious project designed to explore an exciting new hypothesis: TFs are non-randomly spatially organised within the cell nucleus, forming radial gradients that likely play an important role in regulating gene expression. This idea was born from one of the intriguing discoveries revealed by Genomic loci Positioning by Sequencing (GPSeq), a technique developed in the host lab, that the binding motifs of the majority of human transcription factors (TFs) seem to form radial density gradients, with some TF binding motifs being more abundant towards the nuclear periphery, whilst others more abundant in the centre. Furthermore, preliminary analysis showed that the predicted binding motifs of master regulator TFs specifying lymphoid vs myeloid lineages form opposing radial gradients, suggesting that this mode of transcriptional regulation is critical for cell fate specification. In this project, I will differentiate hematopoietic stem cell (HSC) into opposing lineages (lymphoid/myeloid) and perform TF CUT&RUN to assay TF occupancy and chromatin landscape, coupled with GPSeq to assay the radial arrangement of chromatin in these lineages. The intersection of these two genome-wide datasets will provide the first ever map of the occupancy of lineage specific transcription factors through differentiation time and nuclear space with respect to radiality. In parallel I will generate additional omics datasets in these cell populations to assay chromatin accessibility, transcription and chromatin interactions to build a comprehensive, multi-dimensional genomic atlas in which the spatial arrangement of TFs can be linked with gene expression dynamics. Crucially, no other study has thus far addressed this novel hypothesis; my work will provide significant advancements in understanding the interplay of genome architecture with transcriptional regulation and cell-fate specification.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Dieses Projekt wurde noch nicht bei EuroSciVoc klassifiziert.
Schlagen Sie die Wissenschaftsbereiche vor, die Ihrer Einschätzung nach besonders relevant sind, und helfen Sie uns, unseren Klassifizierungsdienst zu verbessern.
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
20157 Milano
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.