Descrizione del progetto
Fattori di trascrizione specifici e il loro ruolo nell’espressione genica
I fattori di trascrizione sono proteine che svolgono un ruolo cruciale nella trascrizione del DNA in RNA. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto GRADMAP studierà l’ipotesi che i fattori di trascrizione siano organizzati dal punto di vista spaziale in modo non casuale all’interno del nucleo cellulare e formino gradienti radiali che potrebbero essere cruciali nella regolazione dell’espressione genica. Differenzierà le cellule staminali ematopoietiche in diversi lignaggi e utilizzerà CUT&RUN per mappare i punti in cui i fattori di trascrizione si legano al DNA nel tempo e all’interno del nucleo.
Obiettivo
Here I propose an ambitious project designed to explore an exciting new hypothesis: TFs are non-randomly spatially organised within the cell nucleus, forming radial gradients that likely play an important role in regulating gene expression. This idea was born from one of the intriguing discoveries revealed by Genomic loci Positioning by Sequencing (GPSeq), a technique developed in the host lab, that the binding motifs of the majority of human transcription factors (TFs) seem to form radial density gradients, with some TF binding motifs being more abundant towards the nuclear periphery, whilst others more abundant in the centre. Furthermore, preliminary analysis showed that the predicted binding motifs of master regulator TFs specifying lymphoid vs myeloid lineages form opposing radial gradients, suggesting that this mode of transcriptional regulation is critical for cell fate specification. In this project, I will differentiate hematopoietic stem cell (HSC) into opposing lineages (lymphoid/myeloid) and perform TF CUT&RUN to assay TF occupancy and chromatin landscape, coupled with GPSeq to assay the radial arrangement of chromatin in these lineages. The intersection of these two genome-wide datasets will provide the first ever map of the occupancy of lineage specific transcription factors through differentiation time and nuclear space with respect to radiality. In parallel I will generate additional omics datasets in these cell populations to assay chromatin accessibility, transcription and chromatin interactions to build a comprehensive, multi-dimensional genomic atlas in which the spatial arrangement of TFs can be linked with gene expression dynamics. Crucially, no other study has thus far addressed this novel hypothesis; my work will provide significant advancements in understanding the interplay of genome architecture with transcriptional regulation and cell-fate specification.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
20157 Milano
Italia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.