Opis projektu
Swoiste czynniki transkrypcyjne i ich rola w ekspresji genów
Czynniki transkrypcyjne to białka, które odgrywają istotną rolę w transkrypcji DNA na RNA. Korzystając ze wsparcia programu działań „Maria Skłodowska-Curie”, zespół projektu GRADMAP podejmie się sprawdzenia słuszności hipotezy, według której czynniki transkrypcyjne są zorganizowane przestrzennie w jądrze komórkowym w sposób nielosowy i tworzą gradienty radialne, które mogą odgrywać istotną rolę w regulacji ekspresji genów. Prace skupią się na różnicowaniu krwiotwórczych komórek macierzystych (HSC) w różnorodne linie i wykorzystaniu metody CUT&RUN do mapowania miejsc, w których czynniki transkrypcyjne wiążą się na DNA na przestrzeni czasu i wewnątrz jądra.
Cel
Here I propose an ambitious project designed to explore an exciting new hypothesis: TFs are non-randomly spatially organised within the cell nucleus, forming radial gradients that likely play an important role in regulating gene expression. This idea was born from one of the intriguing discoveries revealed by Genomic loci Positioning by Sequencing (GPSeq), a technique developed in the host lab, that the binding motifs of the majority of human transcription factors (TFs) seem to form radial density gradients, with some TF binding motifs being more abundant towards the nuclear periphery, whilst others more abundant in the centre. Furthermore, preliminary analysis showed that the predicted binding motifs of master regulator TFs specifying lymphoid vs myeloid lineages form opposing radial gradients, suggesting that this mode of transcriptional regulation is critical for cell fate specification. In this project, I will differentiate hematopoietic stem cell (HSC) into opposing lineages (lymphoid/myeloid) and perform TF CUT&RUN to assay TF occupancy and chromatin landscape, coupled with GPSeq to assay the radial arrangement of chromatin in these lineages. The intersection of these two genome-wide datasets will provide the first ever map of the occupancy of lineage specific transcription factors through differentiation time and nuclear space with respect to radiality. In parallel I will generate additional omics datasets in these cell populations to assay chromatin accessibility, transcription and chromatin interactions to build a comprehensive, multi-dimensional genomic atlas in which the spatial arrangement of TFs can be linked with gene expression dynamics. Crucially, no other study has thus far addressed this novel hypothesis; my work will provide significant advancements in understanding the interplay of genome architecture with transcriptional regulation and cell-fate specification.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Projekt nie został jeszcze sklasyfikowany według klasyfikacji EuroSciVoc.
Wskaż dziedziny nauki, które twoim zdaniem są najbardziej istotne z punktu widzenia tego projektu i pomóż nam usprawnić naszą usługę klasyfikacji.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
20157 Milano
Włochy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.