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Harnessing advanced computational and synthetic biology to understand phage lysin complexity

Projektbeschreibung

Neue Strategien gegen antibiotikaresistente Bakterien

Antibiotikaresistenz stellt unverändert ein dringendes globales Gesundheitsproblem dar und treibt die Suche nach innovativen antibakteriellen Alternativen voran. Lysine sind Enzyme, die von Bakteriophagen produziert werden. Sie haben sich als vielversprechende Werkzeuge erwiesen, da sie die Fähigkeit besitzen, bakterielle Zellwände aufzubrechen und pathogene Bakterien abzutöten. Erste Forschungsergebnisse belegten ein beträchtliches Potenzial, doch der Fortschritt wurde durch das begrenzte Verständnis der Wirkungsweise von Lysinen behindert. Unterstützt über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahme möchte das Projekt COMPLENDO die Struktur, Funktion und Vielfalt von Lysinen untersuchen. Forschende werden fortschrittliche Rechenwerkzeuge und innovative Testplattformen nutzen, um ein tieferes Verständnis der Lysine zu gewinnen. Es wird erwartet, dass die aus dieser Arbeit erzielten Erkenntnisse eine intelligentere Arzneimittelentwicklung ermöglichen und künftige Behandlungen gegen resistente Infektionen unterstützen.

Ziel

"(Endo)lysins are phage-encoded enzymes that degrade the peptidoglycan layer of bacterial cell walls, facilitating the release of viral progeny. Both wild-type and engineered lysins have shown promise as alternatives or complements to antibiotics, of importance in light of rising antimicrobial resistance. However, current lysin research and development (R&D) efforts remain largely empirical, needing resource-intensive screening processes that often yield limited generalizable insights. This challenge is further compounded by the recent failure of the first clinical trial intended as proof-of-concept for lysins as antimicrobials, alongside new findings that demonstrate an unexplored complexity of lysins.

This makes the case for an investment in fundamental research to address unresolved questions about lysin structure and function. Specifically, this project will explore two major issues related to lysins from the two major bacterial macrostructural paradigms, namely: (i) the specificity determinants of enzymatically active domains (EADs) in Gram-positive lysins and (ii) the role of cell wall binding domains (CBDs) and antimicrobial peptide-like elements (AMLEs) in Gram-negative lysins.
To achieve this, I will deploy, for the first time in the field, advanced computational methods to generate fully synthetic lysins that will serve as scaffolds for testing specificity determinants in EADs. In addition, I will develop an ""in virio"" testing platform (IVTP) in collaboration with a research network that this project will help establish. The IVTP will be central to the project, allowing for the evaluation of functional diversity within the context of the phage-host interaction, thus overcoming the applied bias in current lysin research.

Ultimately, this project will deepen our understanding of the newfound complexity of lysins and contribute to the rationalization and de-risking of R&D pipelines addressing one of the 21st century's major healthcare challenges."

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 194 074,56
Adresse
CALLE SERRANO 117
28006 MADRID
Spanien

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Region
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Partner (1)

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