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Harnessing advanced computational and synthetic biology to understand phage lysin complexity

Descrizione del progetto

Nuove strategie contro i batteri resistenti agli antibiotici

La resistenza agli antibiotici continua a rappresentare un problema sanitario globale urgente, che spinge alla ricerca di alternative antibatteriche innovative. Le lisine, enzimi prodotti dai batteriofagi, si sono rivelate strumenti promettenti in quanto hanno la capacità di rompere le pareti cellulari batteriche e uccidere i batteri patogeni. Sebbene le ricerche iniziali abbiano dimostrato un potenziale considerevole, i progressi sono stati ostacolati dalla limitata comprensione del funzionamento delle lisine. Con il supporto del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto COMPLENDO si propone di studiare la struttura, la funzione e la diversità delle lisine. I ricercatori utilizzeranno strumenti computazionali avanzati e piattaforme di test innovative per approfondire la conoscenza delle lisine. Si prevede che le conoscenze acquisite da questo lavoro guideranno lo sviluppo di farmaci più intelligenti e supporteranno futuri trattamenti contro le infezioni resistenti.

Obiettivo

"(Endo)lysins are phage-encoded enzymes that degrade the peptidoglycan layer of bacterial cell walls, facilitating the release of viral progeny. Both wild-type and engineered lysins have shown promise as alternatives or complements to antibiotics, of importance in light of rising antimicrobial resistance. However, current lysin research and development (R&D) efforts remain largely empirical, needing resource-intensive screening processes that often yield limited generalizable insights. This challenge is further compounded by the recent failure of the first clinical trial intended as proof-of-concept for lysins as antimicrobials, alongside new findings that demonstrate an unexplored complexity of lysins.

This makes the case for an investment in fundamental research to address unresolved questions about lysin structure and function. Specifically, this project will explore two major issues related to lysins from the two major bacterial macrostructural paradigms, namely: (i) the specificity determinants of enzymatically active domains (EADs) in Gram-positive lysins and (ii) the role of cell wall binding domains (CBDs) and antimicrobial peptide-like elements (AMLEs) in Gram-negative lysins.
To achieve this, I will deploy, for the first time in the field, advanced computational methods to generate fully synthetic lysins that will serve as scaffolds for testing specificity determinants in EADs. In addition, I will develop an ""in virio"" testing platform (IVTP) in collaboration with a research network that this project will help establish. The IVTP will be central to the project, allowing for the evaluation of functional diversity within the context of the phage-host interaction, thus overcoming the applied bias in current lysin research.

Ultimately, this project will deepen our understanding of the newfound complexity of lysins and contribute to the rationalization and de-risking of R&D pipelines addressing one of the 21st century's major healthcare challenges."

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 194 074,56
Indirizzo
CALLE SERRANO 117
28006 MADRID
Spagna

Mostra sulla mappa

Regione
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partner (1)

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