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Genome Mining-Based Discovery and Engineering of Trojan Horse Peptide Antibiotics Against Gram-Negative Pathogens

Projektbeschreibung

Natürliche Hybridpeptid-basierte Moleküle als neuartige Antibiotika

Die Zunahme resistenter Bakterien, insbesondere gramnegativer Erreger, stellt eine der dringlichsten Bedrohungen der globalen öffentlichen Gesundheit dar. Es besteht dringender Bedarf an Antibiotika mit neuartigen Wirkmechanismen. Eine bislang noch wenig erforschte Methode ist ein seltener, natürlich vorkommender Signalweg, bei dem Hybridmoleküle entstehen, die durch die Verknüpfung zweier unterschiedlicher Peptidklassen mit potenzieller antimikrobieller Wirkung gebildet werden. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen zielt das Team des Projekts TROJAN NRPS-RiPP darauf ab, das aus diesem Signalweg hervorgehende Naturprodukt zu identifizieren und zu charakterisieren. Dabei werden die Struktur und die antibakteriellen Eigenschaften untersucht, ebenso wie das für die Verknüpfung der beiden Peptide verantwortliche Enzym, und die Frage, ob dieses Enzym genutzt werden könnte, um eine neue Palette maßgeschneiderter Antibiotika zu entwickeln.

Ziel

Antimicrobial resistance (AMR) is a growing global threat, with the World Health Organization highlighting Gram-negative pathogens as a critical priority. New antibiotics with innovative modes of action are urgently needed. This project aims to discover and characterize a previously unexplored biosynthetic gene cluster predicted to encode a hybrid natural product that links two major peptide classes: ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs) and nonribosomal peptides (NRPs). Such hybrid pathways are extremely rare and represent a promising but uncharted area for antibiotic discovery.

The first objective is to identify and structurally characterize the natural product encoded by this pathway. This will be achieved using genome mining, bioinformatics, and heterologous expression of candidate genes, followed by isolation and advanced qualitative organic analysis methods such as NMR and MS. The second objective is to investigate the structural basis of the encoded RiPP, which is predicted to form a β-helix through an alternating L/D residue pattern. Biophysical methods will test whether this fold contributes to antibacterial activity, for example through ion channel formation. The third objective is to characterize the unique enzyme responsible for attaching the NRP to the RiPP scaffold, which represents a new enzymatic function at the interface of two biosynthetic classes. This enzyme will be studied using biochemical assays and engineered through directed evolution to assess its potential for generating “mix-and-match” antibiotics.

By combining natural product discovery, structural biology, and enzyme engineering, this interdisciplinary project will provide new insights into peptide biosynthesis and resistance-evading antibiotic mechanisms. The outcomes will include fundamental advances in understanding RiPP–NRP hybrid biosynthesis, along with identification of new antibiotic drug leads to target Gram-negative infections.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 292 118,88
Adresse
Raemistrasse 101
8092 Zuerich
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0