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Decoding the Impact of Nuclear Organization on the Hierarchical VSG Activation in African Trypanosomes

Projektbeschreibung

Mit innovativem Modell die Antigenaktivierung bei Tropenkrankheiten verstehen

Bei der Antigenvariation handelt es sich um eine Strategie, mit der Krankheitserreger die Immunantwort des Wirts umgehen. Die Mechanismen, die die Reihenfolge der Antigenaktivierung bestimmen, sind jedoch noch unklar. Bei Trypanosoma brucei, einem Modellorganismus zur Untersuchung dieses Phänomens, lösen Doppelstrangbrüche in den Antigen-Genen einen Antigenwechsel aus. Das Team des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts VSG-repair wird prüfen, wie DNS-Schäden die Dynamik im Zellkern beeinflussen und die Wahl der DNS-Reparaturwege bestimmen, wodurch die Antigen-Gen-Aktivierung gelenkt wird. Unter Einsatz modernster Verfahren aus dem Siegel-Labor wird Mikroskopie mit genomweiter Kartierung kombiniert, um die Auswirkungen räumlicher Nähe und Sequenzidentität auf die Reparaturergebnisse zu analysieren. Diese Projektarbeit wird ein Modell für die Antigen-Gen-Reparatur liefern und der Entwicklung von Strategien zur Bekämpfung vernachlässigter Tropenkrankheiten dienen.

Ziel

Antigenic variation is a widely employed strategy for evading host immune responses, and it relies on similar functional principles even in evolutionarily divergent pathogens. These principles include the mutually exclusive expression of antigens and the periodic, nonrandom switching of antigen expression during infection. Despite decades of research, the mechanisms governing the order of antigen activation remain unknown.
In Trypanosoma brucei, a model organism for studying antigenic variation, double-stranded breaks (DSBs) within antigen genes (VSGs) act as key triggers for antigen switching. VSG-repair tests the hypothesis that DNA damage reshapes nuclear dynamics in a manner that spatial proximity, together with sequence identity, biases DNA repair template choice and thereby determines the hierarchy of VSG activation.
Building on recent advances in the Siegel lab—and leveraging DSB-inducible switching lines, established gene tagging strategies, and on-site imaging and NGS facilities— VSG-repair combines high-resolution microscopy with genome-wide mapping of homology search and a quantitative integration framework to determine how 3D proximity, sequence identity, and chromatin context influence repair outcomes. Scientifically, this will yield a model of VSG repair and general principles for homology repair-centered, non-model systems. Technologically, it will deliver an adaptable screening strategy suitable for genome tagging or inducible perturbations. Societally, it will strengthen the knowledge needed to address neglected tropical diseases. I bring a strong background in chromatin biology in divergent parasites and, under Prof. Siegel’s supervision, I will acquire complementary expertise in advanced microscopy, single-cell omics, and large-scale screening workflows. This training will equip me with the skills to transition to independence and establish myself as a group leader in chromatin regulation and cellular decision-making in parasitology.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Koordinator

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Netto-EU-Beitrag
€ 202 125,12
Adresse
GESCHWISTER SCHOLL PLATZ 1
80539 Planegg
Deutschland
Region
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
Keine Daten