Opis projektu
Innowacyjny model do badania aktywacji antygenów w chorobach tropikalnych
Zmienność antygenowa jest strategią wykorzystywaną przez patogeny do uniknięcia odpowiedzi immunologicznej gospodarza. Mechanizmy determinujące kolejność aktywacji antygenów pozostają jednak niejasne. W przypadku Trypanosoma brucei, modelu używanego do badania tego zjawiska, pęknięcia dwuniciowe (DSB) w genach antygenów (VSG) wyzwalają przełączanie antygenów. W ramach projektu VSG-repair, wspieranego przez program działań „Maria Skłodowska-Curie”, zbadane zostanie, w jaki sposób uszkodzenia DNA wpływają na dynamikę jądra komórkowego oraz wybór szlaków naprawy DNA, kształtując w ten sposób aktywację VSG. Wykorzystując zaawansowane techniki z laboratorium Siegela, zspół połączy mikroskopię z mapowaniem całego genomu w celu analizy wpływu bliskości przestrzennej i identyczności sekwencji na wyniki naprawy. Projekt dostarczy modelu naprawy genów VSG oraz pozwoli opracować strategie zwalczania zaniedbanych chorób tropikalnych.
Cel
Antigenic variation is a widely employed strategy for evading host immune responses, and it relies on similar functional principles even in evolutionarily divergent pathogens. These principles include the mutually exclusive expression of antigens and the periodic, nonrandom switching of antigen expression during infection. Despite decades of research, the mechanisms governing the order of antigen activation remain unknown.
In Trypanosoma brucei, a model organism for studying antigenic variation, double-stranded breaks (DSBs) within antigen genes (VSGs) act as key triggers for antigen switching. VSG-repair tests the hypothesis that DNA damage reshapes nuclear dynamics in a manner that spatial proximity, together with sequence identity, biases DNA repair template choice and thereby determines the hierarchy of VSG activation.
Building on recent advances in the Siegel lab—and leveraging DSB-inducible switching lines, established gene tagging strategies, and on-site imaging and NGS facilities— VSG-repair combines high-resolution microscopy with genome-wide mapping of homology search and a quantitative integration framework to determine how 3D proximity, sequence identity, and chromatin context influence repair outcomes. Scientifically, this will yield a model of VSG repair and general principles for homology repair-centered, non-model systems. Technologically, it will deliver an adaptable screening strategy suitable for genome tagging or inducible perturbations. Societally, it will strengthen the knowledge needed to address neglected tropical diseases. I bring a strong background in chromatin biology in divergent parasites and, under Prof. Siegel’s supervision, I will acquire complementary expertise in advanced microscopy, single-cell omics, and large-scale screening workflows. This training will equip me with the skills to transition to independence and establish myself as a group leader in chromatin regulation and cellular decision-making in parasitology.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- medycyna i nauki o zdrowiu nauki o zdrowiu parazytologia
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
80539 Planegg
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.