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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Systems Analysis of Plant Metabolism through the Integration of Heterogeneous Data from Genetics, Informatics and Metabolomics

Obiettivo

"The term METABOLISM describes all the chemical reactions and interactions that take place in a biological system. The regulation of metabolic pathways is constantly tuned in order to suit the needs of development and fitness. The main goal of the proposed research is to unravel networks of genes and proteins which coordinate the activity of metabolic pathways during plant development and stress response. In Phase I of the project, an infrastructure will be set-up that includes metabolite analyses technologies, a large tomato mutant population and a collection of tomato transcription factor genes. In Phase II, the population will be screened for novel mutants and genes associated with the research interests of the lab. The screens will include: a) visual screening, b) HTP, non laborious assays, c) non-targeted metabolite analysis for the detection of differential metabolites using LC-MS, and d) screening by a reverse genetic approach (from sequence to mutant) through transposon display. The collection of transcription factors will be used for rapid gene function analysis by means of Virus Induced Gene silencing (VIGS), and for the generation of a tomato transcription factors ""Interactome"" map. In Phase III, selected genes and mutants will be subjected to a detailed characterization including: a) the regulatory networks controlling fruit development, b) the regulation of metabolic pathways associated with plant surface metabolism and c) the regulation of the Isoprenoid pathway (including the glycoalkaloids and carotenoids). Data gathered from diverse platforms and screens will be integrated using computational tools to provide new knowledge on the genetic control of metabolic pathways that is currently very limited. This research addresses a major challenge, namely, the extensive acquisition of an heterogeneous set of data (genetic, gene expression, protein interaction and metabolic) and their integration to identify regulatory networks controlling plant metabolism."

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2007-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Contributo UE
€ 1 009 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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