Objectif
The long-term goal of our research is to advance the state-of-the-art in molecular simulation algorithms by 4-5 orders of magnitude, particularly in the context of the GROMACS software we are developing. This is an immense challenge, but with huge potential rewards: it will be an amazing virtual microscope for basic chemistry, polymer and material science research; it could help us understand the molecular basis of diseases such as Creutzfeldt-Jacob, and it would enable rational design rather than random screening for future drugs. To realize it, we will focus on four critical topics: • ALGORITHMS FOR SIMULATION ON GRAPHICS AND OTHER STREAMING PROCESSORS: Graphics cards and the test Intel 80-core chip are not only the most powerful processors available, but this type of streaming architectures will power many supercomputers in 3-5 years, and it is thus critical that we design new “streamable” MD algorithms. • MULTISCALE MODELING: We will develop virtual-site-based methods to bridge atomic and mesoscopic dynamics, QM/MM, and mixed explicit/implicit solvent models with water layers around macromolecules. • MULTI-LEVEL PARALLEL & DISTRIBUTED SIMULATION: Distributed computing provides virtually infinite computer power, but has been limited to small systems. We will address this by combining SMP parallelization and Markov State Models that partition phase space into transition/local dynamics to enable distributed simulation of arbitrary systems. • EFFICIENT FREE ENERGY CALCULATIONS: We will design algorithms for multi-conformational parallel sampling, implement Bennett Acceptance Ratios in Gromacs, correction terms for PME lattice sums, and combine standard force fields with polarization/multipoles, e.g. Amoeba. We have a very strong track record of converting methodological advances into applications, and the results will have impact on a wide range of fields from biomolecules and polymer science through material simulations and nanotechnology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique multiphysique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2007-StG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
100 44 STOCKHOLM
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.