Ziel
Within the PigSNP project SNPs will be identified that are known to be segregating within commercial European pig breeds. Using the Solexa sequencing technique a representation of the genome is directly sequenced to high redundancy. This is achieved by digesting the DNA with a restriction enzyme and sequencing fragments within a specific size range (i.e. 250 bp). The strategy used is based on sequencing a mixture of the DNA from 5 individuals of a single commercial breed to 20 X depth. Furthermore, the use of 5 individuals per breed (10 haplotypes) will ensure the identification of SNPs with high minor allele frequencies. This approach ensures that SNPs identified will be informative within the commercial line and therefore will be useful not only in experimental QTL crosses but also for genomic selection in current commercial breeding lines. The combination of new generation sequence technology (Solexa) combined with WITHIN breed SNP identification of major SNPs is particular innovative and timely. The SNPs identified will be available to be included in high density SNP panels (within existing international ongoing collaborations) that will be used to genotype available commercial pig breeds. This will aid in the further fine mapping of previously identified QTL within these commercial crosses. Within the project we will use the identified SNPs for fine mapping 2-3 previously identified QTL on chromosomes 2 and 4 identified within an experimental MeishanxEuropean white cross and within a commercial finisher population respectively. Both populations have been used extensively for the identification of several QTL for fatness, carcass and meat quality traits. Within the project it is aimed to identify between 10 and 20 thousand SNPs each for 4 different commercial breeds. QTL fine mapping will be done using the Illumina Golden Gate assay.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Agrarwissenschaften Landwirtschaftliche Biotechnologie markerunterstützte Selektion
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Enzym
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
6708 PB Wageningen
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.