Obiettivo
Within the PigSNP project SNPs will be identified that are known to be segregating within commercial European pig breeds. Using the Solexa sequencing technique a representation of the genome is directly sequenced to high redundancy. This is achieved by digesting the DNA with a restriction enzyme and sequencing fragments within a specific size range (i.e. 250 bp). The strategy used is based on sequencing a mixture of the DNA from 5 individuals of a single commercial breed to 20 X depth. Furthermore, the use of 5 individuals per breed (10 haplotypes) will ensure the identification of SNPs with high minor allele frequencies. This approach ensures that SNPs identified will be informative within the commercial line and therefore will be useful not only in experimental QTL crosses but also for genomic selection in current commercial breeding lines. The combination of new generation sequence technology (Solexa) combined with WITHIN breed SNP identification of major SNPs is particular innovative and timely. The SNPs identified will be available to be included in high density SNP panels (within existing international ongoing collaborations) that will be used to genotype available commercial pig breeds. This will aid in the further fine mapping of previously identified QTL within these commercial crosses. Within the project we will use the identified SNPs for fine mapping 2-3 previously identified QTL on chromosomes 2 and 4 identified within an experimental MeishanxEuropean white cross and within a commercial finisher population respectively. Both populations have been used extensively for the identification of several QTL for fatness, carcass and meat quality traits. Within the project it is aimed to identify between 10 and 20 thousand SNPs each for 4 different commercial breeds. QTL fine mapping will be done using the Illumina Golden Gate assay.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze agricole biotecnologia agricola selezione assistita da marcatori
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
6708 PB Wageningen
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.