Objectif
The identification of the genetic variants underlying adaptive traits constitutes one of the major challenges for modern biology. In this proposal we focus on the ability of plants to tolerate low temperatures. The molecular basis of cold tolerance has been widely investigated in crop species since freezing temperatures can severely affect quality, yield and production. Through the use of the model plant species Arabidopsis thaliana a dramatic increase in the understanding of the genetic mechanisms underlying cold tolerance was achieved. However, many questions remain still open with regard to the nature of the genes involved in the response of plants to cold temperatures. In this project an original, interdisciplinary strategy will be adopted to address naturally occurring variation for cold tolerance in A. thaliana. First, with the aim of identifying the genes underlying variation for cold tolerance in A. thaliana, association mapping will be performed, making use of a set of 1300 A. thaliana accessions, genotyped for 250.000 Single Nucleotide Polymorphisms. In contrast to classical linkage mapping, association mapping has the potential to identify single or a few genes. However, it is affected by population structure, which can eventually lead to a high rate of false positives. Therefore, F2 and F3 progenies will be designed, and used in classical linkage mapping to confirm that associations are due to linkage with causative polymorphisms rather than being spurious correlations due to population structure. Second, to elucidate the selective forces to which the loci identified in the association study have been submitted nucleotide variation will be analyzed at the loci as well as at their surrounding genomic regions and compared to the genome-wide polymorphism pattern. Finally, the candidate loci for cold tolerance identified through association mapping will be submitted to functional analyses in order to confirm their implication in cold tolerance.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles mathématiques mathématiques pures analyse mathématique analyse fonctionnelle
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2007-4-1-IOF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
80539 MUNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.