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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

Analysis of natural variation for cold tolerance in the model plant species Arabidopsis thaliana

Ziel

The identification of the genetic variants underlying adaptive traits constitutes one of the major challenges for modern biology. In this proposal we focus on the ability of plants to tolerate low temperatures. The molecular basis of cold tolerance has been widely investigated in crop species since freezing temperatures can severely affect quality, yield and production. Through the use of the model plant species Arabidopsis thaliana a dramatic increase in the understanding of the genetic mechanisms underlying cold tolerance was achieved. However, many questions remain still open with regard to the nature of the genes involved in the response of plants to cold temperatures. In this project an original, interdisciplinary strategy will be adopted to address naturally occurring variation for cold tolerance in A. thaliana. First, with the aim of identifying the genes underlying variation for cold tolerance in A. thaliana, association mapping will be performed, making use of a set of 1300 A. thaliana accessions, genotyped for 250.000 Single Nucleotide Polymorphisms. In contrast to classical linkage mapping, association mapping has the potential to identify single or a few genes. However, it is affected by population structure, which can eventually lead to a high rate of false positives. Therefore, F2 and F3 progenies will be designed, and used in classical linkage mapping to confirm that associations are due to linkage with causative polymorphisms rather than being spurious correlations due to population structure. Second, to elucidate the selective forces to which the loci identified in the association study have been submitted nucleotide variation will be analyzed at the loci as well as at their surrounding genomic regions and compared to the genome-wide polymorphism pattern. Finally, the candidate loci for cold tolerance identified through association mapping will be submitted to functional analyses in order to confirm their implication in cold tolerance.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2007-4-1-IOF
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Koordinator

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
EU-Beitrag
€ 236 443,30
Adresse
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Deutschland

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Region
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
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