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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Analysis of natural variation for cold tolerance in the model plant species Arabidopsis thaliana

Obiettivo

The identification of the genetic variants underlying adaptive traits constitutes one of the major challenges for modern biology. In this proposal we focus on the ability of plants to tolerate low temperatures. The molecular basis of cold tolerance has been widely investigated in crop species since freezing temperatures can severely affect quality, yield and production. Through the use of the model plant species Arabidopsis thaliana a dramatic increase in the understanding of the genetic mechanisms underlying cold tolerance was achieved. However, many questions remain still open with regard to the nature of the genes involved in the response of plants to cold temperatures. In this project an original, interdisciplinary strategy will be adopted to address naturally occurring variation for cold tolerance in A. thaliana. First, with the aim of identifying the genes underlying variation for cold tolerance in A. thaliana, association mapping will be performed, making use of a set of 1300 A. thaliana accessions, genotyped for 250.000 Single Nucleotide Polymorphisms. In contrast to classical linkage mapping, association mapping has the potential to identify single or a few genes. However, it is affected by population structure, which can eventually lead to a high rate of false positives. Therefore, F2 and F3 progenies will be designed, and used in classical linkage mapping to confirm that associations are due to linkage with causative polymorphisms rather than being spurious correlations due to population structure. Second, to elucidate the selective forces to which the loci identified in the association study have been submitted nucleotide variation will be analyzed at the loci as well as at their surrounding genomic regions and compared to the genome-wide polymorphism pattern. Finally, the candidate loci for cold tolerance identified through association mapping will be submitted to functional analyses in order to confirm their implication in cold tolerance.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2007-4-1-IOF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Coordinatore

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contributo UE
€ 236 443,30
Indirizzo
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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