Ziel
The knowledge of protein structures is critical for understanding of molecular machinery, discovering metabolic pathways, rational drug design and many other aspects of life at the molecular level. The number of currently know protein sequences however greatly outnumber known protein structures. Moreover this gap is rapidly growing. Therefore in the past few decades a number of theoretical approaches have been proposed for computational prediction of protein structures. During this project a novel protocol for protein structure prediction will be developed. A new software will be written, tested and applied on a genomic scale. The approach will be based on novel methodological advances, developed during the project. Among the most important elements are: (i) Multiscale approach: during a modeling process it will be possible to switch between several levels of coarse-graining. Low resolution protein representation will be used for an extremely efficient conformational search. Promising regions of solutions space will be further explored by a more detailed and more accurate model. (ii) A new family of force fields will be designed for accurate calculation of protein's energy at each of levels of coarse-graining (i.e. a separate force field for each levels of coarse-graining). (iii) Novel Monte Carlo techniques will be applied and tuned for further speed-up of conformational sampling. Monte Carlo methods will be also applied at the stage of force field development. (iv) Experimental information obtained from SAXS, EM, NMR, mutagenesis and other techniques will be used to direct the search of the conformational space and to increase modeling accuracy. The novel protocol developed during this project allow for structure determination of proteins and protein-protein complexes in a high-throuput fashion. The method will be shared as a publicly available Internet service and tested on representative benchmarks, e.g. a small genome.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Informatik und Informationswissenschaften Informatik
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
FP7-PEOPLE-2007-4-1-IOF
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
00-927 WARSZAWA
Polen
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.