Metagenomics for bioexploration - Tools and application

Informazioni relative al progetto

METAEXPLORE

ID dell’accordo di sovvenzione: 222625

Progetto chiuso

Data di avvio 1 Maggio 2009

Data di completamento 30 Aprile 2014

Finanziato da

• Specific Programme "Cooperation": Food, Agriculture and Biotechnology

Costo totale € 8 065 047,00

Contributo UE € 5 999 991,00

Coordinato da

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Netherlands

Obiettivo

This proposal will (further) develop and apply metagenomics tools to access the enzymatic potential borne in the cryptic biota of selected natural habitats, in particular target soil-related and aquatic ones. In the light of the environmental relevance of chitins and lignins (as natural compounds recalcitrant to degradation) and halogenated aliphatic and aromatic compounds (anthropogenic recalcitrant compounds), the enzymatic activities that we will target are functions able to degrade these compounds. A database of gene functions will be established and maintained. Next to its great relevance to environmental biotechnology including bioremediation, a spin-off of the work will be the discovery of novel biocatalytic functions of industrial relevance. We will in particular address the catabolic potential that is encoded by the mobilome, the collective pool of mobile genetic elements in the microbiota. We will further apply high-throughput (454-based) sequencing to rapidly unravel the metabolic complement in this mobile gene pool. The project brings together a suite of 15 contractors across Europe, encompassing 21 laboratories spread over 11 copuntries and including 4 SMEs. Most of the partners are renowned laboratories which have vast experience in metagenomics of environmental samples, biotechnology, enzymology, bioinformatics, the mobilome, waste management and bioremediation and enzyme production.

Campo scientifico

• natural sciences › computer and information sciences › databases
• engineering and technology › environmental engineering › waste management
• engineering and technology › environmental biotechnology › bioremediation
• natural sciences › chemical sciences › organic chemistry › aromatic compounds
• natural sciences › biological sciences › biochemistry › biomolecules › proteins › enzymes

Parole chiave

• Biocatalysis
• Environmental metagenomics
• Enzymes for waste and pollutant mitigation
• Mobilome
• Protein engineering

Programma(i)

• FP7-KBBE - Specific Programme "Cooperation": Food, Agriculture and Biotechnology

Argomento(i)

• KBBE-2007-3-3-04 - USEFUL WASTE - Novel biotechnology approaches for utilizing wastes, including aquaculture wastes, to make high added value products
• KBBE-2007-3-3-05 - ACTIVITY MININING IN METAGENOMES – Exploring molecular microbial diversity in aquatic environment or the soil

Invito a presentare proposte

FP7-KBBE-2007-2A
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Meccanismo di finanziamento

CP-IP - Large-scale integrating project

Coordinatore

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN

• Contributo UE: € 876 780,00
• Indirizzo: Broerstraat 5 ; 9712CP Groningen ; Paesi Bassi
• Regione: Noord-Nederland › Groningen › Overig Groningen
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Costo totale: Nessun dato

Partecipanti (17)

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN

Paesi Bassi

• Contributo UE: € 350 000,00
• Indirizzo: Broerstraat 5 ; 9712CP Groningen
• Regione: Noord-Nederland › Groningen › Overig Groningen
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Costo totale: Nessun dato

KOBENHAVNS UNIVERSITET

Danimarca

• Contributo UE: € 386 400,00
• Indirizzo: NORREGADE 10 ; 1165 Kobenhavn
• Regione: Danmark › Hovedstaden › Byen København
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Ivan Kristoffersen (Mr.)
• Costo totale: Nessun dato

SODERTORNS HOGSKOLA

Svezia

• Contributo UE: € 334 760,00
• Indirizzo: Alfred Nobel's Alle 7 ; SE-141 89 Huddinge
• Regione: Östra Sverige › Stockholm › Stockholms län
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Fredrik Stralind (Mr.)
• Costo totale: Nessun dato

UNIVERSITY OF WARWICK

Regno Unito

• Contributo UE: € 389 000,00
• Indirizzo: KIRBY CORNER ROAD UNIVERSITY HOUSE ; CV4 8UW COVENTRY
• Regione: West Midlands (England) › West Midlands › Coventry
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Peter Hedges (Prof.)
• Costo totale: Nessun dato

WAGENINGEN UNIVERSITY

Paesi Bassi

• Contributo UE: € 389 080,00
• Indirizzo: DROEVENDAALSESTEEG 4 ; 6708 PB Wageningen
• Regione: Oost-Nederland › Gelderland › Veluwe
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Jos Teunissen
• Costo totale: Nessun dato

ECOLE CENTRALE DE LYON

Francia

• Contributo UE: € 482 500,00
• Indirizzo: AVENUE GUY DE COLLONGUE 36 ; 69134 Ecully
• Regione: Auvergne-Rhône-Alpes › Rhône-Alpes › Rhône
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Bénédicte Martin (Dr.)
• Costo totale: Nessun dato

UNIVERSITAET BIELEFELD

Germania

• Contributo UE: € 417 600,00
• Indirizzo: UNIVERSITAETSSTRASSE 25 ; 33615 Bielefeld
• Regione: Nordrhein-Westfalen › Detmold › Bielefeld, Kreisfreie Stadt
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Iris Litty (Ms.)
• Costo totale: Nessun dato

JULIUS KUHN-INSTITUT BUNDESFORSCHUNGSINSTITUT FUR KULTURPFLANZEN

Germania

• Contributo UE: € 250 000,00
• Indirizzo: ERWIN-BAUR-STRASSE 27 ; 06484 Quedlinburg
• Regione: Sachsen-Anhalt › Sachsen-Anhalt › Harz
• Tipo di attività: Research Organisations
• Contatto amministrativo: Knut Steffens (Mr.)
• Costo totale: Nessun dato

KATHOLIEKE UNIVERSITEIT LEUVEN

Belgio

• Contributo UE: € 395 000,00
• Indirizzo: OUDE MARKT 13 ; 3000 Leuven
• Regione: Vlaams Gewest › Prov. Vlaams-Brabant › Arr. Leuven
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Maria Vereeken (Ms.)
• Costo totale: Nessun dato

TEKNOLOGIAN TUTKIMUSKESKUS VTT

Finlandia

• Contributo UE: € 395 000,00
• Indirizzo: TEKNIIKANTIE 4 A ; 02044 VTT ESPOO
• Tipo di attività: Research Organisations
• Contatto amministrativo: Seija Flinck (Ms.)
• Costo totale: Nessun dato

UNIVERSITE CATHOLIQUE DE LOUVAIN

Belgio

• Contributo UE: € 338 400,00
• Indirizzo: PLACE DE L UNIVERSITE 1 ; 1348 Louvain La Neuve
• Regione: Région wallonne › Prov. Brabant Wallon › Arr. Nivelles
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Spyridon Nicolas Agathos (Prof.)
• Costo totale: Nessun dato

UNIVERSITA DEGLI STUDI DELL'INSUBRIA

Italia

• Contributo UE: € 291 000,00
• Indirizzo: VIA RAVASI 2 ; 21100 Varese
• Regione: Nord-Ovest › Lombardia › Varese
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Luca Azimonti (Dr.)
• Costo totale: Nessun dato

UNIVERZA V LJUBLJANI

Slovenia

• Contributo UE: € 201 000,00
• Indirizzo: KONGRESNI TRG 12 ; 1000 Ljubljana
• Regione: Slovenija › Zahodna Slovenija › Osrednjeslovenska
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Milena Prosen (Ms.)
• Costo totale: Nessun dato

UNIVERSIDAD NACIONAL DE LA PLATA

Argentina

• Contributo UE: € 165 000,00
• Indirizzo: CALLE 7 776 ; 1900 La Plata
• Tipo di attività: Higher or Secondary Education Establishments
• Contatto amministrativo: Antonio Lagares (Prof.)
• Costo totale: Nessun dato

BioDetection Systems B.V.

Paesi Bassi

• Contributo UE: € 190 000,00
• Indirizzo: Science Park 406 ; 1098 XH Amsterdam
• Regione: West-Nederland › Noord-Holland › Groot-Amsterdam
• Tipo di attività: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Contatto amministrativo: Yvette Van Scheppingen (Ms.)
• Costo totale: Nessun dato

Whitby Seafoods Ltd

Regno Unito

• Contributo UE: € 70 000,00
• Indirizzo: Fairfield Way ; YO22 4PU Whitby
• Tipo di attività: Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
• Contatto amministrativo: Edward Whittle (Mr.)
• Costo totale: Nessun dato

INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT

Francia

• Contributo UE: € 78 471,00
• Indirizzo: 147 RUE DE L'UNIVERSITE ; 75007 Paris
• Regione: Ile-de-France › Ile-de-France › Paris
• Tipo di attività: Research Organisations
• Contatto amministrativo: Nathalie Dospital (Ms.)
• Costo totale: Nessun dato