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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Comprehensive characterization of epigentic reprogramming in cancer

Obiettivo

Epigenetics refers to heritable changes in gene expression patterns, brought about by modifications to DNA and chromatin. Aberrant epigenetic activity was shown to play important roles in the tumorigenic process. Two major epigenetic systems are known: DNA methylation and the histone modification machinery, an important component of which is the Polycomb Repressive Complexes (PRC) system. Recent works have suggested that a link between the two systems exists in cancer cells. Previous work on the interaction between DNA methylation and PRC activity was mostly limited to studies of a small number of genes leading to partial and conflicting results. I propose a long term comprehensive study that aims to examine the correlated epigenetic changes in these systems occurring through the spectrum of the tumorigenic process. This is made possible by a new methodology we have developed involving simultaneous genome-wide profiling of DNA methylation and PRC activity followed by robust computational analysis of the data. This gives us a unique ability to probe correlated changes of the various epigenetic systems. The project will be based on an established lab-computational-biotech collaboration and will entail simultaneous genome-wide profiling of epigenetic systems in normal and cancer cells and in various stages of the immortalization/transformation process. Results of the initial phase of this study show significant interplay between the two epigenetic systems. In particular, it appears that the two silencing mechanisms act in parallel to reprogram the cancer epigenome, and that DNA hypermethylation may replace Polycomb based repression near key regulatory genes, possibly reducing their regulatory flexibility. I expect the project to lead to a characterization of the gradual evolution of epigenetic states during the tumorigenic process, and their contribution to the transformation of normal cells to cancer cells.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2007-4-3-IRG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IRG - International Re-integration Grants (IRG)

Coordinatore

MEDICAL RESEARCH INFRASTRUCTURE DEVELOPMENT AND HEALTH SERVICES FUND BY THE SHEBA MEDICAL CENTER
Contributo UE
€ 100 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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