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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Integrating modeling into plant systems biology: Applications to auxin-driven plant morphogenesis

Obiettivo

Plant science is evolving from a reductionistic view on gene function to an integrated systems biology approach. Gene function of genes is now studied in the context of the dynamic behavior of physiological, cellular or developmental processes. Mathematical and computational modeling play a central role in this approach. During the initial Marie Curie Fellowship, I worked as a biomodeller at the primarily experimental VIB Department of Plant Systems Biology (PSB) in Ghent, Belgium. Based on this work, PSB has awarded me a “Young Leader” position, which includes a five year position as a group leader and budget for a PhD student. In this position, I have started up the group “Plant Systems Modeling” that is currently composed of myself (PI), a postdoc, three PhD students, and two Master’s students. The European Reintegration Grant would support further development of this group and thus ensure full reintegration. The Plant Systems Modeling group aims to build predictive models of auxin-driven tissue morphogenesis that can act as hypothesis-generators for wet-lab research. The project consists of the following two work packages: WP 1 To predict from first principles the spatio-temporal expression patterns of the major players of early vascular patterning in Arabidopsis, including PIN, AUX and auxin. This model will extend on the traveling-wave mechanism for auxin canalization that we have proposed recently (Merks et al, Trends in Plant Science, 2007). WP 2 To unravel the molecular mechanisms behind the recent observation that auxin oscillations regulate lateral root initiation (De Smet et al., Development 2007). For this we will develop a growing, multicellular model of auxin-flux-regulated patterning in the root basal meristem.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-ERG-2008
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-ERG - European Re-integration Grants (ERG)

Coordinatore

STICHTING CENTRUM VOOR WISKUNDE EN INFORMATICA
Contributo UE
€ 45 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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