Ziel
The transfer of peptide segments into the lipid bilayer to form stable transmembrane helices is the crucial first step in membrane protein folding and assembly. However, the mechanisms that drive this process are not fully understood. A recent experimental assay has measured the insertion of designed peptide sequences into the endoplasmic reticulum membrane via the cellular translocon machinery. This has provided the first quantitative estimate of the translocon-to-membrane transfer free energy of polypeptide segments. However, no suitable experimental setup currently exists that allows the direct measurement of the free energy change involved in transferring peptides from water into lipid bilayers. This is because peptides that are hydrophobic enough to insert into membranes generally aggregate in solution. I propose an experimental peptide setup that directly measures the water to bilayer partitioning of a series of designed peptides that do not have this problem. These will be derived by minor re-engineering of pHLIP, a peptide based on helix C of bacteriorhodopsin. This peptide has a set of unique properties that make it ideal for the proposed study. It is soluble at neutral pH and spontaneously inserts into lipid bilayers when the pH is lowered. Remarkably, the peptide partitions as a monomer, without disrupting the bilayer, and has been shown not to aggregate either in solution or inside the bilayer. For theoreticians the proposed direct measurements are highly desirable, since they allow the calibration of current computer simulation models under identical conditions. Recent advances in algorithms and computer hardware have enabled fully converged simulations of the adsorption, folding and insertion of peptides into lipid bilayers. These studies have exposed striking differences between the various different methods used as well as currently established theory, which cannot be resolved without a suitable experimental dataset like the one proposed here.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-IOF-2008
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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Koordinator
WC1E 7HX LONDON
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.