Cel
The transfer of peptide segments into the lipid bilayer to form stable transmembrane helices is the crucial first step in membrane protein folding and assembly. However, the mechanisms that drive this process are not fully understood. A recent experimental assay has measured the insertion of designed peptide sequences into the endoplasmic reticulum membrane via the cellular translocon machinery. This has provided the first quantitative estimate of the translocon-to-membrane transfer free energy of polypeptide segments. However, no suitable experimental setup currently exists that allows the direct measurement of the free energy change involved in transferring peptides from water into lipid bilayers. This is because peptides that are hydrophobic enough to insert into membranes generally aggregate in solution. I propose an experimental peptide setup that directly measures the water to bilayer partitioning of a series of designed peptides that do not have this problem. These will be derived by minor re-engineering of pHLIP, a peptide based on helix C of bacteriorhodopsin. This peptide has a set of unique properties that make it ideal for the proposed study. It is soluble at neutral pH and spontaneously inserts into lipid bilayers when the pH is lowered. Remarkably, the peptide partitions as a monomer, without disrupting the bilayer, and has been shown not to aggregate either in solution or inside the bilayer. For theoreticians the proposed direct measurements are highly desirable, since they allow the calibration of current computer simulation models under identical conditions. Recent advances in algorithms and computer hardware have enabled fully converged simulations of the adsorption, folding and insertion of peptides into lipid bilayers. These studies have exposed striking differences between the various different methods used as well as currently established theory, which cannot be resolved without a suitable experimental dataset like the one proposed here.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki lipidy
- inżynieria i technologia inżynieria elektryczna, inżynieria elektroniczna, inżynieria informatyczna inżynieria elektroniczna sprzęt komputerowy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka fałdowanie białek
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka stosowana model matematyczny
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
FP7-PEOPLE-IOF-2008
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
WC1E 7HX London
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.