Obiettivo
Protein-protein interactions are keys to executing important cellular functions. We hypothesize that gain or loss of protein-protein interactions plays important roles in carcinogenesis. We propose a network-based approach to biomarker discovery that uses protein-protein interactions and regulatory transcriptional networks. We will use prostate cancer and gliomas as models. Prostate cancer is the most common form of cancer and the leading cause of cancer death among men in the developed countries. Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common and most aggressive type of primary brain tumor and it GBM accounts for 52% of all primary brain tumor cases. Novel markers and therapeutic targets are still needed for these two cancers. We will be focusing on the androgen receptor protein-protein network in prostate cancer and TGF-beta mediated network in gliomas. Protein interactions will be extracted by text mining, from databases, and from structural data on protein complexes. To identify transcription factors and their targets in human, ChIP-Chip and ChIP-Seq experiments will be carried out. The resulting networks serve as a scaffold on which data of deregulated proteins derived from microarray and next-generation sequencing of patient cancer samples will be mapped. The perturbed subnetwork will be visualized with a new method that identifies and highlights network motifs and modules. Promising biomarker candidates will be further examined and validated experimentally. Where possible, candidates will be modelled using protein structural data on protein-protein complexes, providing the basis to design ligands that occupy binding sites in order to disrupt cancer-relevant interactions. Our proposal is highly innovative. We expect to identify key nodal points in the network, to which protein-protein interactions can be disrupted as a way to perturb or interfere with the network. These key nodal points will serve both as biomarkers and therapeutic targets.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia carcinoma della prostata
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione basi di dati
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IRSES
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MC-IRSES - International research staff exchange scheme (IRSES)
Coordinatore
01069 Dresden
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.