Obiettivo
Epidemiology and public health planning will increasingly rely on the analysis of genetic sequence data. The recent swine-derived influenza A/H1N1 pandemic may represent a tipping point in this trend, as it is arguably the first time when multiple strains of a human pathogen have been sequenced essentially in real time from the very beginning of its spread. However, the full potential of genetic information cannot be fully exploited to infer the spread of epidemics due to the lack of statistical methodologies capable of reconstructing transmission routes from genetic data structured both in time and space. To address this urgent need, we propose to develop a methodological framework for the reconstruction of the spatiotemporal dynamics of disease outbreaks and epidemics based on genetic sequence data. Rather than reconstructing most recent common ancestors as in phylogenetics, we will directly infer the most likely ancestries among the sampled isolates. This represents an entirely novel paradigm and allows for the development of statistically coherent and powerful inference software within a Bayesian framework. The methodological framework will be developed in parallel with the analysis of real genetic/genomic data from important human pathogens. We will in particular focus on the 2009 A/H1N1 pandemic influenza, methicilin-resistant Staphylococcus aureus clones (MRSAs), Batrachochytrium dendrobatidis, a fungus currently devastating amphibian populations worldwide. The tools we are proposing to develop are likely to impact radically on the field of infectious disease epidemiology and affect the way infectious emerging pathogens are monitored by biologists and public health professionals.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione software
- scienze mediche e della salute scienze della salute salute pubblica epidemiologia pandemie
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia micologia
- scienze mediche e della salute scienze della salute malattie infettive virus a RNA influenza
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
ERC-2010-StG_20091118
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Istituzione ospitante
WC1E 6BT LONDON
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.