Objectif
The objective of this project is to investigate nanofluidic single-molecule approaches to DNA mapping using a new denaturation mapping concept developed by W. Reisner. We propose to make advances in extending these approaches to true genome scale applications. We will furthermore demonstrate that epigenomic as well as genomic variations can be mapped with these approaches. Eventually, we seek to develop a device for mapping DNA that was extracted from single-cells on-chip. At the first stage of the project, the fellow will work with Prof. Reisner (McGill Univ.), who is a leader in nanofluidics for DNA analysis, and who will enable basic advances towards genome-scale and epigenetic mapping applications. Here, the fellow will study DNA mapping techniques and will learn how to design and fabricate nanofluidic devices for that purpose. Nanofabrication encompasses highly specialised tools and techniques which the fellow requires throughout the project. At the second stage, the fellow will be hosted by Prof. A. Kristensen (Techn. Univ. of Denmark) who is an expert in nanoimprinting and microfluidics. He will enable advances towards implementing inexpensive fabrication processes with integrated microfluidics for single-cell lysis and DNA purification. The fellow will therefore learn fabrication of polymer-based devices which can be mass-produced inexpensively by injection molding and nanoimprinting. Furthermore, the fellow will learn how to operate the fabricated on-chip devices with integrated single-cell lysis and DNA purification, and subsequent DNA mapping. The broad range of competencies the fellow will acquire throughout the project will help him establish an independent career in micro/nanofluidics.
The proposed advances will contribute to technologies that can (1) speed-up large-scale genome assembly (2) analyse epigenomes/genomes from large ensembles of cells and (3) do so in an inexpensive format that can be widely distributed to potential biomedical end-users.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques mécanique classique mécanique des fluides microfluidics
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique épigénomes
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2010-IOF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
2800 KONGENS LYNGBY
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.