Ziel
"Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic, disabling, complex autoimmune disease with a strong genetic component. After the well known HLA-DRB1 and PTPN22 genetic loci, the next most strongly associated locus is an intergenic region on 6q23, 180 Kb from the candidate gene TNFAIP3. The causal variants and their functional effects have not been identified yet. The aim of this project is to identify all causal variants in the region and determine how they function to increase RA risk.
The first step will be to understand the complete genetic architecture of the locus. I will use data from in-depth fine mapping and resequencing studies of the region, followed by case-control association studies to identify all associated variants including common and rare SNPs, CNVs and indels. Bioinformatic analysis will help to prioritize variants for subsequent functional characterization and will guide the design of experiments. Complementary to that, cDNA sequencing of the region will be undertaken to explore whether the intergenic region is truly noncoding or whether any hitherto undetected transcriptional activity is present. This will allow me to simultaneously determine the effect of different SNP alleles on the levels of expression by allele differential expression measurement.
Since associated variants map a considerable distance from the candidate gene, I will test whether distant regulatory elements lie at the site of disease variants through chromosome conformation capture. Finally the mechanism by which variants disrupt transcriptional regulation will be elucidated by performing formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements and chromatin immunoprecipitation.
The outcome will be the identification of all causal variants in 6q23 and the elucidation of their functional role in the predisposition to RA. This will help to understand the aetiology of RA and autoimmunity and, potentially, to develop new therapeutic targets."
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Rheumatologie
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2010-RG
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
M13 9PL Manchester
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.