Objectif
"Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic, disabling, complex autoimmune disease with a strong genetic component. After the well known HLA-DRB1 and PTPN22 genetic loci, the next most strongly associated locus is an intergenic region on 6q23, 180 Kb from the candidate gene TNFAIP3. The causal variants and their functional effects have not been identified yet. The aim of this project is to identify all causal variants in the region and determine how they function to increase RA risk.
The first step will be to understand the complete genetic architecture of the locus. I will use data from in-depth fine mapping and resequencing studies of the region, followed by case-control association studies to identify all associated variants including common and rare SNPs, CNVs and indels. Bioinformatic analysis will help to prioritize variants for subsequent functional characterization and will guide the design of experiments. Complementary to that, cDNA sequencing of the region will be undertaken to explore whether the intergenic region is truly noncoding or whether any hitherto undetected transcriptional activity is present. This will allow me to simultaneously determine the effect of different SNP alleles on the levels of expression by allele differential expression measurement.
Since associated variants map a considerable distance from the candidate gene, I will test whether distant regulatory elements lie at the site of disease variants through chromosome conformation capture. Finally the mechanism by which variants disrupt transcriptional regulation will be elucidated by performing formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements and chromatin immunoprecipitation.
The outcome will be the identification of all causal variants in 6q23 and the elucidation of their functional role in the predisposition to RA. This will help to understand the aetiology of RA and autoimmunity and, potentially, to develop new therapeutic targets."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine clinique rhumatologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie maladies auto-immunes
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2010-RG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
M13 9PL Manchester
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.