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Contenuto archiviato il 2024-05-29

Regulation of transposable elements in plants and impact on genome evolution

Obiettivo

Transposable elements (TEs) are mobile genetic elements present in virtually all genomes. They make up nearly half of the total amount of DNA in plant genomes, so definition of their influence on genome structure and gene expression is of clear significance to the understanding of global genome regulation and phenotype variations. The movement of TEs within genomes can generate mutations by interrupting or modifying the regulation or the coding capacity of genes, and recombination between transposon copies located at different chromosomal regions can generate chromosomal rearrangements. Work done over the last few years has confirmed that TEs are at the origin of an important number of genes and regulatory sequences and that transposition has been essential for the evolution of complex genomes. They also have an important role in chromatin structure and function. Miniature Inverted Repeat Transposable Elements (MITEs) constitute a particular type of mobile elements that are present in high copy numbers in genomes. The objective of the project is to study the impact of MITEs in the regulation of nearby genes and to analyze their possible role as genome organizer elements. To this end, we will start applying dedicated bioinformatic tools to complete the Arabidopsis MITE landscape, and we will analyze the epigenetic marks associated to these elements. In a second stage of the project we will analyze their influence on the expression of neighboring genes taking advantage of the variability of MITE insertions in different Arabidopsis ecotypes. Finally, we will analyze the possible role of selected MITE families as genome organizers, by studying their localization in chromosomes by fluorescent in situ hybridization (FISH) analysis and by chromosome conformation capture approaches. In conclusion, this project constitutes an exciting combination of bioinformatics and cellular and molecular biology approaches for the analysis of genome structure and regulation via TEs.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2010-RG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-ERG - European Re-integration Grants (ERG)

Coordinatore

CENTRE DE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC-IRTA-UAB-UB
Contributo UE
€ 45 000,00
Indirizzo
PARC DE RECERCA DE L UAB CAMPUS UAB EDIFICI CRAG BELLATERRA
08193 Cerdanyola Del Valles
Spagna

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Regione
Este Cataluña Barcelona
Tipo di attività
Other
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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