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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Trans-national Infrastructure for Plant Genomic Science

Descrizione del progetto


Data infrastructures for e-Science

Food and energy security are major challenges facing humanity in the coming decades. The falling costs of nucleotide sequencing are opening up significant opportunities for crop improvement through plant breeding and increased understanding of plant biology; in particular through interpreting the growing volume of plant genomics data in the context of phenotype. However, at present, there is no adequare infrastructre for plant genomic data. transPLANT will develop a new infrastructure for this data, leveraging the experience of medical informatics while addressing the particular challenges and opportunities of plant genomics.
Compared with vertebrate genomes, plant genomes may be large and have complex evolutinary histories, which makes their analysis a hard problem (both in terms of theory, and in terms of the compute resources required for data storage and analysis). Issues include genome size, polyploidy, and the quantity, diversity and dispersed nature of data in need of integration.
To address these problems, transPLANT will develop distributed solutions, exploiting the expertise of the project partners in particular species and problems to provide a seamless set of computational and interactive services to the plant research community. These services will be developed on top of the outputs of RTD activities designed to build new repositories and develop new algorithms, and with the input from the plant science and other related communities garnered through extensive networking activities. A series of training workshops will educate the community in the use of transPLANT tools and data.
transPLANT will be built on standard technologies for data exchange and representation, service provision, virtual compute infrastructure, and interface development; where such standards are currently lacking (as in phenotype description), they will be developed in the context of the project.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-INFRASTRUCTURES-2011-2
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

CPCSA - Combined Collaborative Project and Coordination and Support Action

Coordinatore

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Contributo UE
€ 920 523,00
Indirizzo
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (10)

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