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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Mechanistic studies of T-DNA integration into plant genome

Obiettivo

Plant genetic transformation is a fascinating process by which the Agrobacterium transforms its host by delivering a well-defined fraction of its own genome (designated transfer DNA or T-DNA) as a single-stranded (ss) DNA molecule (designated T-strand) into the host cell. The T-DNA integrates into the host genome and is expressed there. Many of the biological mechanisms that govern the transformation process remain poorly understood and our understanding of the mechanisms by which T-DNA molecules integrate into the host-cell genome is still sketchy. The T-DNA molecule does not code for the machinery needed for its transport and integration into the plant genome. Thus, the T-DNA sequence can potentially be replaced by any other sequence of interest without affecting the transformation and integration process, which is likely to be governed largely by plant proteins and machineries. T-DNA molecules were shown to be capturable by genomic double-strand breaks (DSBs), which led to the suggestion that DSBs may act as ‘hot spots’ for T-DNA integration. Data from my laboratory suggest that a double-stranded (ds) intermediate (dsT-DNA) may serve as a dominant substrate in the integration process. The mechanism by which T-strands are complemented to dsT-DNAs is still unknown and to the best of our knowledge, have never been studied and we have only recently begun to reveal the molecular mechanisms by which dsT-DNA molecules integrate into genomic DSBs. My hypothesis is that dsT-DNA intermediate molecules and genomic DSBs play a significant role in T-DNA integration and in my interdisciplinary proposal I plan to combine the use of functional assays, biochemical studies, genetic approaches and imaging methods to (i) unveil the molecular mechanism of T-strand complementation to dsT-DNA and (ii) study the role played by DSBs in capturing dsT-DNA molecules.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2011-CIG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Coordinatore

BEN-GURION UNIVERSITY OF THE NEGEV
Contributo UE
€ 100 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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