Ziel
A pivotal question in developmental biology is how cellular gene regulatory networks can respond to a signalling molecule in a concentration-dependent manner. This can now be studied using the modern tools of synthetic biology, an emerging research field that applies engineering approaches to biological systems.
This project aims to adapt and develop a band-forming model in E. coli. It will explore systematically the parameter and network space that regulates the formation of a single stripe of gene expression in a morphogen gradient. The full design space of 3-gene networks, where one gene is activated by the morphogen, is 9,710 (isometric networks removed). We are therefore building a flexible network 'scaffold' that will allow the construction of any such circuit and, in particular, the six core topologies predicted in silico to form single stripes.
Rational design of gene regulatory networks in vivo is extremely challenging, due to the complex interactions in living cells. Therefore, we are exploring the parameter space that leads to functional band-forming networks by building combinatorial libraries, followed by selection for an appropriate survival pressure.
The synthetic networks are engineered with the potential to react as concentration band filters, with respect to a morphogen concentration. The RNA polymerases from the T7 and SP6 phages are used as activators and artificial zinc finger DNA-binding domains, cI and lacI as repressors. The output of the gene regulatory networks is a selectable gene, fused to a green fluorescent protein, which can be used for selection, counterselection and quantification.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2011-IEF
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
08003 Barcelona
Spanien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.