Objectif
Phylogenetics, the study of evolutionary relationships among groups of species, is a well-established interdisciplinary scientific field. Until today, phylogeneticists put a lot of effort into the precise reconstruction of evolutionary trees. However, in recent years, the research focus on reconstructing phylogenetic trees is turning towards the reconstruction of phylogenetic networks because evolution cannot be properly represented as a tree. For example, a comparison of several trees that all represent a given set of present-day species and have been reconstructed for different genetic loci often reveals conflicting tree topologies. These discrepancies are not always due to missampling or uncertainty in the tree reconstruction method, but rather due to reticulation (e.g. horizontal gene transfer, hybridization, or recombination).
Since phylogenetic networks are far more complex than phylogenetic trees, new mathematical and computational tools are needed. This proposal suggests new directions of research within the broad area of phylogenetic networks. First, we will develop new (fixed-parameter) algorithms to analyze intrahost recombination in viruses and apply them to biological data sets. This will provide new insight into the evolution of RNA viruses (e.g. HIV), which is essential in the development of any medication. Second, noting that many questions that are polynomial-time solvable for phylogenetic trees are NP-hard for when stated in terms of networks, we will tackle these harder questions by using novel methodology. Instead of directly solving a problem for a network, we will transform a given network into a tree by using the concept of tree-decompositions, and then solve an `easier' problem for the obtained tree. In particular, we will investigate problems related to the parsimony score of a phylogenetic network and supernetworks.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IOF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
72074 Tuebingen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.