Objectif
"The proposed project aims to identify the dynamics of RNA-protein interactions during DNA damage response (DDR) using high-throughput “omics” approaches.
The mechanistic basis of DDR has been classically thought to consist of an ""early"" post-translational response, which results in activation of several signalling pathways and transciption factors. These activate the ""late"" transcriptional reprogramming influencing DNA repair, cell cycle regulation and apoptosis. However, for an immediate and effective response, global post-transcriptional control of mRNA stability, splicing and translation may be crucial during “immediate-to-early” DDR.
In this project, I will employ biochemical, cell, systems biology and computational approaches to study the relevance of post-transcriptional regulators such as RNA-binding proteins and microRNAs in DDR. Quantitative proteomics will be applied to identify the differentially mRNA-bound proteins after the exposure of human cultured cells to ionizing radiation. Validation of protein candidates will be carried out by biochemical and deep sequencing approaches. In addition, I will characterize the transcriptome-wide response of existing RNA molecules as well as the newly synthesized transcripts. This will provide a global insight into the dynamics of RNAs and proteins during DDR.
The proposed project explores a previously uncharacterized link between post-transcriptional RNA operons and DDR. The results and implementations of this project will significantly contribute to the understanding of the regulation of DDR, as well as have potential clinical and translational impact. Novel tumour-specific RNA-protein interacting partners may serve as candidates to selectively induce cell death in tumour cells.
The proposed project will enable a focused career development period in the scope of European mobility for the researcher who will gain a high level of expertise in systems biology and establish several international collaborations."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences physiques physique nucléaire
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
13125 Berlin
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.