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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Solving an evolutionary jigsaw puzzle: A next-generation genomics approach to trace the origins of the eukaryotic cell

Obiettivo

The origin of the eukaryotic cell represents an enigmatic yet dramatically incomplete evolutionary puzzle. The few pieces of this puzzle that we have managed to identify thus far indicate that the eukaryotic cell most probably emerged via a fusion of an archaeal and an alphaproteobacterial cell. Yet, beyond this, scientific debate is mainly engulfed by speculation, which, to a large extent, is fed by our poor understanding of the identity of these bacterial and archaeal fusion partners. In the current research proposal, I aim to identify contemporary relatives of the bacterial and archaeal lineages that once founded the eukaryotic cell using novel single-cell genomics and phylogenomics approaches. Till this end, environmental samples that are enriched for the target microbial lineages will be collected and analyzed at the single cell level. A novel microdroplet-based single-cell analysis platform will be implemented that allows for the analysis of millions of individual cells. After target cells have been identified, their genomic material will be amplified, and subjected to next-generation sequencing analysis. Subsequent state-of-the-art phylogenomic analyses will elucidate the taxonomic affiliation of these target cells in relation to other archaeal and bacterial lineages, as well as to eukaryotes. The proposed strategy will identify hundreds of novel prokaryotic lineages, some of which representing close contemporary relatives of the ‘parental’ lineages that founded the eukaryotic cell. The genomic exploration of these lineages will add the taxonomic resolution that is needed to start solving the evolutionary puzzle of the emergence of the eukaryotic cell.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2012-StG_20111109
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

UPPSALA UNIVERSITET
Contributo UE
€ 1 721 440,00
Indirizzo
VON KRAEMERS ALLE 4
751 05 Uppsala
Svezia

Mostra sulla mappa

Regione
Östra Sverige Östra Mellansverige Uppsala län
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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