Ziel
tRNA molecules are key in translating the genetic information into a protein sequence and critical for all aspects of cellular metabolism. Interestingly, tRNAs carry a plethora of chemical modifications, thought to regulate their function. Many of these modifications are evolutionarily highly conserved, and some linked to human degenerative diseases and cancer. However, we know little about their in vivo function and the mechanisms of how aberrations in tRNA modification lead to cellular phenotypes.
Thus, my proposal aims at gaining mechanistic insights into the in vivo function of tRNA modifications by performing a comprehensive systems analysis of tRNA modification pathways in yeast: First, I will identify transcripts, which are abnormally translated in tRNA modification mutants, thus causing the observed phenotypes. Importantly, I will define the codon signatures that are the underlying cause. Second, I will develop a mass spectrometric LC-MS/MS-based workflow, allowing for a quantitative and sequence specific analysis of RNA modifications, which is currently not done in Europe. Third, by combining population analyses and long-term evolution experiments, I will address how tRNA modifications constrain the evolution of genomes and modulate cellular stress responses.
To achieve my goals, I will combine novel technologies and genetics in an unprecedented manner to push the limits of our understanding. I will employ ribosome profiling, a novel method, that provides high-resolution snapshots of the translatome. I will use quantitative RNA mass spectrometry to establish the link between tRNA modification and changes in translation. Finally, I will use quantitative protein mass spectrometry to verify the translation effects of tRNA hypomodification at the proteome level.
Taken together, my project will for the first time unbiasedly link tRNA modifications and translation in vivo by a systems approach and provide an important service to the European RNA community.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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ERC-2012-StG_20111109
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Gastgebende Einrichtung
80539 MUNCHEN
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.