Cel
tRNA molecules are key in translating the genetic information into a protein sequence and critical for all aspects of cellular metabolism. Interestingly, tRNAs carry a plethora of chemical modifications, thought to regulate their function. Many of these modifications are evolutionarily highly conserved, and some linked to human degenerative diseases and cancer. However, we know little about their in vivo function and the mechanisms of how aberrations in tRNA modification lead to cellular phenotypes.
Thus, my proposal aims at gaining mechanistic insights into the in vivo function of tRNA modifications by performing a comprehensive systems analysis of tRNA modification pathways in yeast: First, I will identify transcripts, which are abnormally translated in tRNA modification mutants, thus causing the observed phenotypes. Importantly, I will define the codon signatures that are the underlying cause. Second, I will develop a mass spectrometric LC-MS/MS-based workflow, allowing for a quantitative and sequence specific analysis of RNA modifications, which is currently not done in Europe. Third, by combining population analyses and long-term evolution experiments, I will address how tRNA modifications constrain the evolution of genomes and modulate cellular stress responses.
To achieve my goals, I will combine novel technologies and genetics in an unprecedented manner to push the limits of our understanding. I will employ ribosome profiling, a novel method, that provides high-resolution snapshots of the translatome. I will use quantitative RNA mass spectrometry to establish the link between tRNA modification and changes in translation. Finally, I will use quantitative protein mass spectrometry to verify the translation effects of tRNA hypomodification at the proteome level.
Taken together, my project will for the first time unbiasedly link tRNA modifications and translation in vivo by a systems approach and provide an important service to the European RNA community.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia analityczna spektrometria mas
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
ERC-2012-StG_20111109
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Instytucja przyjmująca
80539 MUNCHEN
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.