Obiettivo
Regulation of RNA stability is recognized as a widely used strategy to regulate protein abundance in time and space in all eukaryotes. RNA degradation regulates gene expression in various processes during development and differentiation and in changing physiological conditions. Many elements of the RNA decay machinery have been identified, but details of their function remain elusive.
The exosome is a multi-subunit exonuclease complex that functions in turnover, quality control and processing of many RNA species. Depending on its subcellular localization it requires different accessory protein complexes that specifically target RNAs towards the exosome and stimulate the degradation process. In the yeast cytosol the Ski complex is the major accessory factor of the exosome. It is required for nearly all exosome-mediated mRNA degradation processes. The core Ski complex is formed by Ski2, an RNA helicase, the large TPR protein Ski3 and two copies of Ski8. This core complex interacts genetically and physically with the exosome via the GTPase Ski7.
In the proposed project, I will study how the activities of the Ski238 complex, Ski7p and the exosome are concerted. For this I will recombinantly express, purify and crystallize the Ski2387 complex alone and together with the exosome to learn about their interaction on atomic level. This approach structural approach will be complemented by electron microscopic studies of the complexes. The results of the structural analysis will guide the design of subsequent functional biochemical and in vivo studies.
The study will be exemplary for the understanding of the functioning of an important cellular machinery in atomic detail.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche biologia cellulare
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
80539 Munchen
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.