Obiettivo
Most eukaryotic genes are transcribed by RNA polymerase II (Pol II) in a cycle of initiation, elongation and termination. Transcription termination, defined as the cessation of RNA synthesis and release of Pol II from its DNA template, depends on a functional poly(A) sequence as well as downstream terminator sequences. Correct termination is important for the prevention of transcriptional interference, efficient protein production and Pol II recycling. Further on, aberrant poly(A) usage and alterations of 3' UTR length have been functionally linked to cancer.
Despite its vital importance, transcription termination mechanisms have only been studied on a handful of genes, and the general principles ruling this process are unknown. In particular, the influence of the chromatin context on Pol II termination is an enigma.
The objective of this proposal is to elucidate the genetic and epigenetic signature of transcription termination genome-wide using a combination of computational, genetic and biochemical approaches. First, a systematic in silico screening will be performed for chromatin modifications and transcription factors' occupancy, as well as DNA sequence elements in putative terminator regions. It will be based on the model genes and their termination pathways dissected in the host lab, as well as a wide range of publicly available and self-generated genome-wide data sets of chromatin-associated features. This unbiased screening will yield the first insight into the genome-wide characteristics (signature) of terminator elements, allowing for subsequent functional studies using hypothesis-driven experimental approaches.
The implementation of this proposal will strongly enhance the researcher's competence by training in the field of RNA processing, complementary to her background in chromatin biology and bioinformatics, foster the development of her interdisciplinary skills and ultimately support her in attaining a future group leader position.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
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- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
OX1 2JD Oxford
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.