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Contenuto archiviato il 2024-06-18

The role of recombination in evolution and epidemiology of bacterial pathogen Streptococcus pneumoniae

Obiettivo

The aim of this project is to improve our understanding of the role of recombination (uptake and incorporation of foreign DNA) for the evolution and epidemiology of the major human bacterial pathogen Streptococcus pneumoniae, also known as the pneumococcus. There is an increasing appreciation of the public health significance of recombination in S. pneumoniae, where recombination has enabled major drug-resistant lineages to rapidly evade new conjugate vaccines. Here, I propose to investigate the role of different mechanisms of recombination in the context of (a) coevolution of the pathogen with the human immune system, (b) generation of novel antigenic diversity at the capsular locus, and (c) adaptation to clinical treatment by generation of novel bacterial lineages carrying multi-drug resistant genes and vaccine “escape” antigens. To do so, I will use an interdisciplinary approach of evolutionary microbiology, immunology, and epidemiology of infectious diseases. First, I will employ a generic evolutionary-epidemiological modelling approach to understand the population dynamic of recombination. Second, I will analyse newly available pneumococcal full-genome sequences to examine the link between recombination, immunity, vaccine, and drug-resistance in pneumococcus. The benefit of this research will be threefold. First, a better understanding of the role of recombination in coevolution with the human populations would be of benefit to the field of bacterial evolution and microbiology in general. Second, the approach outlined here can be applied to study recombination in other recombinogenic bacterial pathogens, like Neisseria meningitidis, Salmonella enterica or Helicobacter pylori. Finally, gaining further insight into the predicted long-term response against the current and future vaccines would help in the design of more effective forms of clinical interventions and help saving children’ lives.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2012-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
Contributo UE
€ 221 606,40
Indirizzo
SOUTH KENSINGTON CAMPUS EXHIBITION ROAD
SW7 2AZ London
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
London Inner London — West Westminster
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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