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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Single-cell phylogenomic exploration of archaeal dark matter

Obiettivo

While the archaeal domain of life was discovered more than 30 years ago, the biology of archaeal organisms remains to be relatively obscure, especially when compared to that of bacterial and eukaryotic life. Yet, despite the limited knowledge regarding their lifestyle and ecological relevance, evidence is mounting that certain archaea play key roles in global nitrogen and carbon cycles. In addition, archaea share a common branch in the tree of life with the eukaryotes, and have most likely played a prominent role in the emergence of the eukaryotic cell, and thus of complex life. Interestingly, recent ecological surveys have started to reveal a hidden diversity of archaeal life. The exploration of this supposed ‘archaeal dark matter’ might thus hold relevance for a number of fundamental issues and reveal profound insights about the diversity, ecology and evolution of the archaeal domain of life. Unfortunately, characterization of these uncultured lineages is procrastinated by limitations in cultivation techniques and limited availability of genetic tools, urging for the exploration of alternative strategies to do so.
Here I am proposing to utilize a single-cell phylogenomics approach to explore novel archaeal lineages at the genomic level. Habitats hosting novel archaea will be sampled and single-cell genome sequencing will be performed using next-generation sequencing technology. The proposed strategy will result in (1) obtaining a better sampling of archaeal genomes, (2) gaining insight in the evolutionary history of the archaeal domain of life through phylogenomics, and (3) obtaining information regarding the biology and lifestyle of these novel archaeal lineages. This work will dramatically increase the number of archaeal genomes available in public databases for both researchers studying the physiology of archaea in different environments and also for evolutionary biologists tracing the evolutionary history of the three domains of life.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2012-IIF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Coordinatore

UPPSALA UNIVERSITET
Contributo UE
€ 197 811,60
Indirizzo
VON KRAEMERS ALLE 4
751 05 Uppsala
Svezia

Mostra sulla mappa

Regione
Östra Sverige Östra Mellansverige Uppsala län
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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