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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Synergistic Modelling of Molecular Effects via Chemical and Biological Data Integration

Obiettivo

While conventionally effects of a chemical structure on a biological system have been determined for individual compounds, one at a time, it is now becoming apparent that biological effects of compound combination are not additive, but often conditional (antagonistic or synergistic) in nature. This phenomenon is of relevance both in the medicinal context (where drugs can be combined to have a synergistic effect), as well as the area of toxicology (where the simultaneous application of compounds shows a toxicity that is non-additive). However, it is not yet clear how to model, and anticipate, which compound combinations show this type of effect.

Hence, in this work I will derive models of synergistic compound combinations, which will be prospectively validated in experiments. Furthermore, I will describe how to capture the effect of a chemical structure on a biological system on multiple levels, namely by considering structural features of the compound, its bioactivity profile, and pathway annotations and their relationship to the phenotypic effect observed. By integrating the data generated in a biologically meaningful way, this allows us to generate predictive models for the bioactivity of compound combinations. The relevance of this work ranges from the question which drugs can be combined in a synergistic manner and which combinations should rather be avoided to the safety assessment of chemicals. Hence, with this work I will be able to improve upon the current state-of-the-art in bioactivity data integration and modelling approaches, as well as deliver concrete models for the bioactivity assessment of compound combinations.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2013-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contributo UE
€ 1 499 558,00
Indirizzo
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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