Cel
"Although protein dynamics plays an essential role in function, it is rarely considered explicitly in current structure-based approaches to drug design. Here I propose the computer-aided design of ligands by modulation of protein dynamics, or equivalently, protein structural ensembles. The detailed understanding of ligand-induced perturbations of protein dynamics that will result from this study is crucial not just to accurately predicting binding affinities and tackling ""undruggable"" targets, but also to understanding protein allostery.
Three major aims will be pursued during this project.
First, I will combine concepts from chemoinformatics and non-equilibrium thermodynamics to detect cryptic ""druggable"" small molecule binding sites in computed structural ensembles. New computational methods will be developed to predict how binding at these putative sites is likely to influence protein function. This will enable rational approaches to allosteric control of protein function.
Second, new classes of non-equilibrium sampling algorithms will be developed to improve by 2-3 orders of magnitude the speed of computation of protein/ligand structural ensembles by molecular simulations. This will enable routine consideration of protein flexibility in ligand optimisation problems.
Third, I will address with the above methods a frontier problem in molecular recognition: the rational design of protein isoform-specific ligands. To achieve this goal, I will integrate computation with experiments and focus efforts on the therapeutically relevant cyclophilin protein family. Experimental work will involve the use of purchased or custom-synthesized competitive and allosteric ligands in enzymatic assays, calorimetry and crystal structure analyses.
Overall, this project proposes fundamental advances in our ability to quantify and engineer protein-ligand interactions, therefore expanding opportunities for the development of future small molecule therapeutics."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna chemia leków
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne termodynamika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze informatyka nauki obliczeniowe
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia analityczna kalorymetria
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
ERC-2013-StG
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Instytucja przyjmująca
EH8 9YL Edinburgh
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.