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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Noise in gene expression as a determinant of virulence of the human pathogen Streptococcus pneumoniae

Obiettivo

Not all cells in bacterial populations exhibit exactly the same phenotype, even though they grow in the same environment and are genetically identical. One of the main driving forces of phenotypic variation is stochasticity, or noise, in gene expression. Possible molecular origins contributing to noise in protein synthesis are stochastic fluctuations in the biochemical reactions of gene expression itself, namely transcription and translation.

The driving hypothesis of this application is that the human pathogen Streptococcus pneumoniae utilizes noisy gene expression to successfully colonize and invade its host. To test this supposition, the total amount of noise in key regulatory networks for virulence factor production will be quantified. Using natural and synthetic bistable switches as highly sensitive probes for noise, in combination with state-of-the-art single-cell imaging, microfluidics and direct transcriptome sequencing, the molecular mechanisms underlying noise generation in S. pneumoniae will be determined. By constructing strains with altered levels of phenotypic variation, the importance of noisy gene expression in S. pneumoniae pathogenesis will be tested.

S. pneumoniae is a leading cause of bacterial pneumoniae, meningitis, and sepsis worldwide. The molecular mechanisms that cause switching of S. pneumoniae to its virulent states are barely understood, although it becomes increasingly clear that noise-driven phenotypic variation plays an important role in pneumococcal pathogenesis. Therefore, understanding the molecular origins of phenotypic variation in S. pneumoniae might not only provide novel fundamental insights in gene expression, but also result in the identification of new anti-pneumococcal targets.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2013-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Contributo UE
€ 1 498 846,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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