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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-29

Environmental and meta-genomics - a bioinformatic system to detect and assign functions to habitat specific gene patterns

Ziel

More than 99% of the microbial diversity on earth still resists cultivation. To exploit this nearly inexhaustible natural resource of new genes and functions direct cloning and sequencing of large DNA fragments from the environment (the metagenome) is the ongoing goal of many researchers worldwide. Nevertheless, more than 50 to 70% of the genes currently found on the genomes and metagenomes lack functional assignments, representing so called hypothetical genes. This shortcoming will be addressed by our new integrative approach that correlates possible gene functions by taking into account habitat specific data and global patterns of gene distribution. First approaches to map biodiversity of cultivated microorganisms and correlate it with ecological and geogr aphical data have already been published, but without genomic data. Independently, the existence of clusters of genes across genomes is documented. No methodology or database integrates these two kinds of information in a single concept at this time. There fore the time is ripe to develop a new integrative system combining genomic and ecological data by using Geographic Information Systems (GIS) in a "Metagenomes Mapserver". The project will result in a new basic technology to systematically store, analyse, visualize and evaluate ecological, geographical and genomic data together. A proof of usefulness will already be given in the proposed project, as data on the carbon and sulfur-cycles will be linked with genomic data from specific sites to predict gene pat terns with potential functions involved in these globally important processes. This proposal is ideally suited for the high risk/high impact NEST program as it cuts across several scientific disciplines and only a few institutes worldwide can develop such a system (high risk). Once it has been installed and its usefulness proven, new areas of scientific development in data mining for environmental monitoring and biotechnology will be possible (high impact)

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2003-NEST-A
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

NoE - Network of Excellence

Koordinator

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FOERDERUNG DER WISSENSCHAFTEN E.V.; REPRESENTED BY MAX PLANCK INSTITUTE FOR MARINE MICROBIOLOGY
EU-Beitrag
Keine Daten
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (3)

Mein Booklet 0 0