Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano it
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS
Contenuto archiviato il 2024-05-29

Environmental and meta-genomics - a bioinformatic system to detect and assign functions to habitat specific gene patterns

Obiettivo

More than 99% of the microbial diversity on earth still resists cultivation. To exploit this nearly inexhaustible natural resource of new genes and functions direct cloning and sequencing of large DNA fragments from the environment (the metagenome) is the ongoing goal of many researchers worldwide. Nevertheless, more than 50 to 70% of the genes currently found on the genomes and metagenomes lack functional assignments, representing so called hypothetical genes. This shortcoming will be addressed by our new integrative approach that correlates possible gene functions by taking into account habitat specific data and global patterns of gene distribution. First approaches to map biodiversity of cultivated microorganisms and correlate it with ecological and geogr aphical data have already been published, but without genomic data. Independently, the existence of clusters of genes across genomes is documented. No methodology or database integrates these two kinds of information in a single concept at this time. There fore the time is ripe to develop a new integrative system combining genomic and ecological data by using Geographic Information Systems (GIS) in a "Metagenomes Mapserver". The project will result in a new basic technology to systematically store, analyse, visualize and evaluate ecological, geographical and genomic data together. A proof of usefulness will already be given in the proposed project, as data on the carbon and sulfur-cycles will be linked with genomic data from specific sites to predict gene pat terns with potential functions involved in these globally important processes. This proposal is ideally suited for the high risk/high impact NEST program as it cuts across several scientific disciplines and only a few institutes worldwide can develop such a system (high risk). Once it has been installed and its usefulness proven, new areas of scientific development in data mining for environmental monitoring and biotechnology will be possible (high impact)

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione

Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2003-NEST-A
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

NoE - Network of Excellence

Coordinatore

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FOERDERUNG DER WISSENSCHAFTEN E.V.; REPRESENTED BY MAX PLANCK INSTITUTE FOR MARINE MICROBIOLOGY
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (3)

Il mio fascicolo 0 0