Complexity and dynamics of nucleic acids modifications in vivo

Informations projet

dynamicmodifications

N° de convention de subvention: 648879

DOI

10.3030/648879

Projet clôturé

Date de signature de la CE 30 Juillet 2015

Date de début 1 Août 2015

Date de fin 31 Mai 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 000 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 000 000,00

Coordonné par

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
United Kingdom

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (18)

Oxidative stress in sperm affects the epigenetic reprogramming in early embryonic development

Auteurs: Sarah Wyck; C. Herrera; Cristina E. Requena; Lilli Bittner; Petra Hajkova; Heinrich Bollwein; Raffaella Santoro
Publié dans: Epigenetics & Chromatin, Numéro 1, 2018, ISSN 1756-8935
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13072-018-0224-y

Mechanistic insights into cytosine-N3 methylation by DNA methyltransferase DNMT3A

Auteurs: Michael Dukatz, Cristina E Requena, Max Emperle, Petra Hajkova, Peter Sarkies, Albert Jeltsch
Publié dans: Journal of molecular biology, Numéro 00222836, 2019, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.06.015

Overexpression of TET dioxygenases in seminomas associates with low levels of DNA methylation and hydroxymethylation.

Auteurs: Martina Benešová; Kateřina Trejbalová; Dana Kučerová; Zdenka Vernerová; Tomáš Hron; Arpád Szabó; Rachel Amouroux; Petr Klézl; Petra Hajkova; Jiří Hejnar
Publié dans: Molecular Carcinogenesis, Numéro 1, 2017, ISSN 1098-2744
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/mc.22638

Epigenetic reprogramming enables the transition from primordial germ cell to gonocyte

Auteurs: Peter W. S. Hill, Harry G. Leitch, Cristina E. Requena, Zhiyi Sun, Rachel Amouroux, Monica Roman-Trufero, Malgorzata Borkowska, Jolyon Terragni, Romualdas Vaisvila, Sarah Linnett, Hakan Bagci, Gopuraja Dharmalingham, Vanja Haberle, Boris Lenhard, Yu Zheng, Sriharsa Pradhan, Petra Hajkova
Publié dans: Nature, Numéro 555/7696, 2018, Page(s) 392-396, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature25964

De novo DNA methylation drives 5hmC accumulation in mouse zygotes

Auteurs: Rachel Amouroux, Buhe Nashun, Kenjiro Shirane, Shoma Nakagawa, Peter W. S. Hill, Zelpha D’Souza, Manabu Nakayama, Masashi Matsuda, Aleksandra Turp, Elodie Ndjetehe, Vesela Encheva, Nobuaki R. Kudo, Haruhiko Koseki, Hiroyuki Sasaki, Petra Hajkova
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 18/2, 2016, Page(s) 225-233, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncb3296

Eggs sense high-fat diet

Auteurs: Harry G. Leitch, Petra Hajkova
Publié dans: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0068-1

Methylation of DNA Ligase 1 by G9a/GLP Recruits UHRF1 to Replicating DNA and Regulates DNA Methylation

Auteurs: Laure Ferry, Alexandra Fournier, Takeshi Tsusaka, Guillaume Adelmant, Tadahiro Shimazu, Shohei Matano, Olivier Kirsh, Rachel Amouroux, Naoshi Dohmae, Takehiro Suzuki, Guillaume J. Filion, Wen Deng, Maud de Dieuleveult, Lauriane Fritsch, Srikanth Kudithipudi, Albert Jeltsch, Heinrich Leonhardt, Petra Hajkova, Jarrod A. Marto, Kyohei Arita, Yoichi Shinkai, Pierre-Antoine Defossez
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 67/4, 2017, Page(s) 550-565.e5, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2017.07.012

Dynamic changes in H1 subtype composition during epigenetic reprogramming

Auteurs: Annalisa Izzo, Céline Ziegler-Birling, Peter W.S. Hill, Lydia Brondani, Petra Hajkova, Maria-Elena Torres-Padilla, Robert Schneider
Publié dans: The Journal of Cell Biology, Numéro 216/10, 2017, Page(s) 3017-3028, ISSN 0021-9525
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201611012

Evolutionary analysis indicates that DNA alkylation damage is a byproduct of cytosine DNA methyltransferase activity

Auteurs: Silvana Rošić, Rachel Amouroux, Cristina E. Requena, Ana Gomes, Max Emperle, Toni Beltran, Jayant K. Rane, Sarah Linnett, Murray E. Selkirk, Philipp H. Schiffer, Allison J. Bancroft, Richard K. Grencis, Albert Jeltsch, Petra Hajkova, Peter Sarkies
Publié dans: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0061-8

DNA (De)Methylation: The Passive Route to Naïvety?

Auteurs: Harry G. Leitch, M. Azim Surani, Petra Hajkova
Publié dans: Trends in Genetics, Numéro 32/10, 2016, Page(s) 592-595, ISSN 0168-9525
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2016.08.005

Evolutionary Persistence of DNA Methylation for Millions of Years after Ancient Loss of a De Novo Methyltransferase

Auteurs: Sandra Catania, Phillip A Dumesic, Harold Pimentel, Ammar Nasif, Caitlin I Stoddard, Jordan E Burke, Jolene K Diedrich, Sophie Cooke, Terrance Shea, Elizabeth Gienger, Robert Lintner, John R Yates III, Petra Hajkova, Geeta J Narlikar, Christina A Cuomo, Jonathan K Pritchard, Hiten D Madhani
Publié dans: Cell, 2020, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.12.012

Dynamic DNA methylation: In the right place at the right time

Auteurs: Chongyuan Luo; Petra Hajkova; Joseph R. Ecker
Publié dans: Science, Numéro 00368075, 2018, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aat6806

Oral vitamin C supplementation to patients with myeloid cancer on azacitidine treatment: Normalization of plasma vitamin C induces epigenetic changes

Auteurs: Linn Gillberg, Andreas D Ørskov, Ammar Nasif, Hitoshi Ohtani, Zachary Madaj, Jakob W Hansen, Nicolas Rapin, Johanne B Mogensen, Minmin Liu, Inge H Dufva, Jens Lykkesfeldt, Petra Hajkova, Peter A Jones, Kirsten Grønbæk
Publié dans: Clinical epigenetics, 2019, ISSN 1868-7075
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1186/s13148-019-0739-5

SLIC-CAGE: high-resolution transcription start site mapping using nanogram-levels of total RNA.

Auteurs: Nevena Cvetesic; Harry G. Leitch; Malgorzata Borkowska; Ferenc Müller; Piero Carninci; Petra Hajkova; Boris Lenhard; Boris Lenhard
Publié dans: Genome Research, Numéro 1, 2018, ISSN 1088-9051
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.235937.118

TBPL2/TFIIA complex establishes the maternal transcriptome through oocyte-specific promoter usage

Auteurs: Changwei Yu, Nevena Cvetesic, Vincent Hisler, Kapil Gupta, Tao Ye, Emese Gazdag, Luc Negroni, Petra Hajkova, Imre Berger, Boris Lenhard, Ferenc Müller, Stéphane D Vincent, László Tora
Publié dans: Nature communications, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20239-4

Sex-specific chromatin remodelling safeguards transcription in germ cells.

Auteurs: Tien-Chi Huang, Yi-Fang Wang, Eric Vazquez-Ferrer, Ina Theofel, Cristina E. Requena, Courtney W. Hanna, Gavin Kelsey & Petra Hajkova
Publié dans: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04208-5

Specification and epigenomic resetting of the pig germline exhibit conservation with the human lineage

Auteurs: Qifan Zhu, Fei Sang, Sarah Withey, Walfred Tang, Sabine Dietmann, Doris Klisch, Priscila Ramos-Ibeas, Haixin Zhang, Cristina E Requena, Petra Hajkova, Matt Loose, M Azim Surani, Ramiro Alberio
Publié dans: Cell Reports, 2021, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.108735

TET2 Regulates the Neuroinflammatory Response in Microglia

Auteurs: Alejandro Carrillo-Jimenez, Özgen Deniz, Maria Victoria Niklison-Chirou, Rocio Ruiz, Karina Bezerra-Salomao, Vassilis Stratoulias, Rachel Amouroux, Ping Kei Yip, Anna Vilalta, Mathilde Cheray, Alexander Michael Scott-Egerton, Eloy Rivas, Khadija Tayara, Irene García-Domínguez, Juan Garcia-Revilla, Juan Carlos Fernandez-Martin, Ana Maria Espinosa-Oliva, Xianli Shen, Peter St George-Hyslop, Guy C
Publié dans: Cell Reports, 2019, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.013

Other (1)

Global regulatory transitions at core promoters demarcate the mammalian germline cycle

Auteurs: Nevena Cvetesic; Malgorzata Borkowska; Yuki Hatanaka; Harry G. Leitch; Ferenc Müller; Changwei Yu; Stéphane D. Vincent; Laszlo Tora; Petra Hajkova; Boris Lenhard
Publié dans: BioRxiv, 2020
Éditeur: Cold Spring Harbour Laboratory
DOI: 10.1101/2020.10.30.361865