Complexity and dynamics of nucleic acids modifications in vivo

Informacje na temat projektu

dynamicmodifications

Identyfikator umowy o grant: 648879

DOI

10.3030/648879

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 30 Lipca 2015

Data rozpoczęcia 1 Sierpnia 2015

Data zakończenia 31 Maja 2022

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 000 000,00

Wkład UE

€ 2 000 000,00

Koordynowany przez

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (18)

Oxidative stress in sperm affects the epigenetic reprogramming in early embryonic development

Autorzy: Sarah Wyck; C. Herrera; Cristina E. Requena; Lilli Bittner; Petra Hajkova; Heinrich Bollwein; Raffaella Santoro
Opublikowane w: Epigenetics & Chromatin, Numer 1, 2018, ISSN 1756-8935
Wydawca: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13072-018-0224-y

Mechanistic insights into cytosine-N3 methylation by DNA methyltransferase DNMT3A

Autorzy: Michael Dukatz, Cristina E Requena, Max Emperle, Petra Hajkova, Peter Sarkies, Albert Jeltsch
Opublikowane w: Journal of molecular biology, Numer 00222836, 2019, ISSN 0022-2836
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.06.015

Overexpression of TET dioxygenases in seminomas associates with low levels of DNA methylation and hydroxymethylation.

Autorzy: Martina Benešová; Kateřina Trejbalová; Dana Kučerová; Zdenka Vernerová; Tomáš Hron; Arpád Szabó; Rachel Amouroux; Petr Klézl; Petra Hajkova; Jiří Hejnar
Opublikowane w: Molecular Carcinogenesis, Numer 1, 2017, ISSN 1098-2744
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1002/mc.22638

Epigenetic reprogramming enables the transition from primordial germ cell to gonocyte

Autorzy: Peter W. S. Hill, Harry G. Leitch, Cristina E. Requena, Zhiyi Sun, Rachel Amouroux, Monica Roman-Trufero, Malgorzata Borkowska, Jolyon Terragni, Romualdas Vaisvila, Sarah Linnett, Hakan Bagci, Gopuraja Dharmalingham, Vanja Haberle, Boris Lenhard, Yu Zheng, Sriharsa Pradhan, Petra Hajkova
Opublikowane w: Nature, Numer 555/7696, 2018, Strona(/y) 392-396, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature25964

De novo DNA methylation drives 5hmC accumulation in mouse zygotes

Autorzy: Rachel Amouroux, Buhe Nashun, Kenjiro Shirane, Shoma Nakagawa, Peter W. S. Hill, Zelpha D’Souza, Manabu Nakayama, Masashi Matsuda, Aleksandra Turp, Elodie Ndjetehe, Vesela Encheva, Nobuaki R. Kudo, Haruhiko Koseki, Hiroyuki Sasaki, Petra Hajkova
Opublikowane w: Nature Cell Biology, Numer 18/2, 2016, Strona(/y) 225-233, ISSN 1465-7392
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncb3296

Eggs sense high-fat diet

Autorzy: Harry G. Leitch, Petra Hajkova
Opublikowane w: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0068-1

Methylation of DNA Ligase 1 by G9a/GLP Recruits UHRF1 to Replicating DNA and Regulates DNA Methylation

Autorzy: Laure Ferry, Alexandra Fournier, Takeshi Tsusaka, Guillaume Adelmant, Tadahiro Shimazu, Shohei Matano, Olivier Kirsh, Rachel Amouroux, Naoshi Dohmae, Takehiro Suzuki, Guillaume J. Filion, Wen Deng, Maud de Dieuleveult, Lauriane Fritsch, Srikanth Kudithipudi, Albert Jeltsch, Heinrich Leonhardt, Petra Hajkova, Jarrod A. Marto, Kyohei Arita, Yoichi Shinkai, Pierre-Antoine Defossez
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 67/4, 2017, Strona(/y) 550-565.e5, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2017.07.012

Dynamic changes in H1 subtype composition during epigenetic reprogramming

Autorzy: Annalisa Izzo, Céline Ziegler-Birling, Peter W.S. Hill, Lydia Brondani, Petra Hajkova, Maria-Elena Torres-Padilla, Robert Schneider
Opublikowane w: The Journal of Cell Biology, Numer 216/10, 2017, Strona(/y) 3017-3028, ISSN 0021-9525
Wydawca: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201611012

Evolutionary analysis indicates that DNA alkylation damage is a byproduct of cytosine DNA methyltransferase activity

Autorzy: Silvana Rošić, Rachel Amouroux, Cristina E. Requena, Ana Gomes, Max Emperle, Toni Beltran, Jayant K. Rane, Sarah Linnett, Murray E. Selkirk, Philipp H. Schiffer, Allison J. Bancroft, Richard K. Grencis, Albert Jeltsch, Petra Hajkova, Peter Sarkies
Opublikowane w: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0061-8

DNA (De)Methylation: The Passive Route to Naïvety?

Autorzy: Harry G. Leitch, M. Azim Surani, Petra Hajkova
Opublikowane w: Trends in Genetics, Numer 32/10, 2016, Strona(/y) 592-595, ISSN 0168-9525
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2016.08.005

Evolutionary Persistence of DNA Methylation for Millions of Years after Ancient Loss of a De Novo Methyltransferase

Autorzy: Sandra Catania, Phillip A Dumesic, Harold Pimentel, Ammar Nasif, Caitlin I Stoddard, Jordan E Burke, Jolene K Diedrich, Sophie Cooke, Terrance Shea, Elizabeth Gienger, Robert Lintner, John R Yates III, Petra Hajkova, Geeta J Narlikar, Christina A Cuomo, Jonathan K Pritchard, Hiten D Madhani
Opublikowane w: Cell, 2020, ISSN 0092-8674
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.12.012

Dynamic DNA methylation: In the right place at the right time

Autorzy: Chongyuan Luo; Petra Hajkova; Joseph R. Ecker
Opublikowane w: Science, Numer 00368075, 2018, ISSN 0036-8075
Wydawca: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aat6806

Oral vitamin C supplementation to patients with myeloid cancer on azacitidine treatment: Normalization of plasma vitamin C induces epigenetic changes

Autorzy: Linn Gillberg, Andreas D Ørskov, Ammar Nasif, Hitoshi Ohtani, Zachary Madaj, Jakob W Hansen, Nicolas Rapin, Johanne B Mogensen, Minmin Liu, Inge H Dufva, Jens Lykkesfeldt, Petra Hajkova, Peter A Jones, Kirsten Grønbæk
Opublikowane w: Clinical epigenetics, 2019, ISSN 1868-7075
Wydawca: Springer Verlag
DOI: 10.1186/s13148-019-0739-5

SLIC-CAGE: high-resolution transcription start site mapping using nanogram-levels of total RNA.

Autorzy: Nevena Cvetesic; Harry G. Leitch; Malgorzata Borkowska; Ferenc Müller; Piero Carninci; Petra Hajkova; Boris Lenhard; Boris Lenhard
Opublikowane w: Genome Research, Numer 1, 2018, ISSN 1088-9051
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.235937.118

TBPL2/TFIIA complex establishes the maternal transcriptome through oocyte-specific promoter usage

Autorzy: Changwei Yu, Nevena Cvetesic, Vincent Hisler, Kapil Gupta, Tao Ye, Emese Gazdag, Luc Negroni, Petra Hajkova, Imre Berger, Boris Lenhard, Ferenc Müller, Stéphane D Vincent, László Tora
Opublikowane w: Nature communications, 2020, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20239-4

Sex-specific chromatin remodelling safeguards transcription in germ cells.

Autorzy: Tien-Chi Huang, Yi-Fang Wang, Eric Vazquez-Ferrer, Ina Theofel, Cristina E. Requena, Courtney W. Hanna, Gavin Kelsey & Petra Hajkova
Opublikowane w: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04208-5

Specification and epigenomic resetting of the pig germline exhibit conservation with the human lineage

Autorzy: Qifan Zhu, Fei Sang, Sarah Withey, Walfred Tang, Sabine Dietmann, Doris Klisch, Priscila Ramos-Ibeas, Haixin Zhang, Cristina E Requena, Petra Hajkova, Matt Loose, M Azim Surani, Ramiro Alberio
Opublikowane w: Cell Reports, 2021, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.108735

TET2 Regulates the Neuroinflammatory Response in Microglia

Autorzy: Alejandro Carrillo-Jimenez, Özgen Deniz, Maria Victoria Niklison-Chirou, Rocio Ruiz, Karina Bezerra-Salomao, Vassilis Stratoulias, Rachel Amouroux, Ping Kei Yip, Anna Vilalta, Mathilde Cheray, Alexander Michael Scott-Egerton, Eloy Rivas, Khadija Tayara, Irene García-Domínguez, Juan Garcia-Revilla, Juan Carlos Fernandez-Martin, Ana Maria Espinosa-Oliva, Xianli Shen, Peter St George-Hyslop, Guy C
Opublikowane w: Cell Reports, 2019, ISSN 2211-1247
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.013

Other (1)

Global regulatory transitions at core promoters demarcate the mammalian germline cycle

Autorzy: Nevena Cvetesic; Malgorzata Borkowska; Yuki Hatanaka; Harry G. Leitch; Ferenc Müller; Changwei Yu; Stéphane D. Vincent; Laszlo Tora; Petra Hajkova; Boris Lenhard
Opublikowane w: BioRxiv, 2020
Wydawca: Cold Spring Harbour Laboratory
DOI: 10.1101/2020.10.30.361865