Complexity and dynamics of nucleic acids modifications in vivo

Projektinformationen

dynamicmodifications

ID Finanzhilfevereinbarung: 648879

DOI

10.3030/648879

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 30 Juli 2015

Startdatum 1 August 2015

Enddatum 31 Mai 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 000 000,00

EU-Beitrag

€ 2 000 000,00

Koordiniert durch

IMPERIAL COLLEGE OF SCIENCE TECHNOLOGY AND MEDICINE
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (18)

Oxidative stress in sperm affects the epigenetic reprogramming in early embryonic development

Autoren: Sarah Wyck; C. Herrera; Cristina E. Requena; Lilli Bittner; Petra Hajkova; Heinrich Bollwein; Raffaella Santoro
Veröffentlicht in: Epigenetics & Chromatin, Ausgabe 1, 2018, ISSN 1756-8935
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13072-018-0224-y

Mechanistic insights into cytosine-N3 methylation by DNA methyltransferase DNMT3A

Autoren: Michael Dukatz, Cristina E Requena, Max Emperle, Petra Hajkova, Peter Sarkies, Albert Jeltsch
Veröffentlicht in: Journal of molecular biology, Ausgabe 00222836, 2019, ISSN 0022-2836
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.06.015

Overexpression of TET dioxygenases in seminomas associates with low levels of DNA methylation and hydroxymethylation.

Autoren: Martina Benešová; Kateřina Trejbalová; Dana Kučerová; Zdenka Vernerová; Tomáš Hron; Arpád Szabó; Rachel Amouroux; Petr Klézl; Petra Hajkova; Jiří Hejnar
Veröffentlicht in: Molecular Carcinogenesis, Ausgabe 1, 2017, ISSN 1098-2744
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/mc.22638

Epigenetic reprogramming enables the transition from primordial germ cell to gonocyte

Autoren: Peter W. S. Hill, Harry G. Leitch, Cristina E. Requena, Zhiyi Sun, Rachel Amouroux, Monica Roman-Trufero, Malgorzata Borkowska, Jolyon Terragni, Romualdas Vaisvila, Sarah Linnett, Hakan Bagci, Gopuraja Dharmalingham, Vanja Haberle, Boris Lenhard, Yu Zheng, Sriharsa Pradhan, Petra Hajkova
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 555/7696, 2018, Seite(n) 392-396, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature25964

De novo DNA methylation drives 5hmC accumulation in mouse zygotes

Autoren: Rachel Amouroux, Buhe Nashun, Kenjiro Shirane, Shoma Nakagawa, Peter W. S. Hill, Zelpha D’Souza, Manabu Nakayama, Masashi Matsuda, Aleksandra Turp, Elodie Ndjetehe, Vesela Encheva, Nobuaki R. Kudo, Haruhiko Koseki, Hiroyuki Sasaki, Petra Hajkova
Veröffentlicht in: Nature Cell Biology, Ausgabe 18/2, 2016, Seite(n) 225-233, ISSN 1465-7392
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncb3296

Eggs sense high-fat diet

Autoren: Harry G. Leitch, Petra Hajkova
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0068-1

Methylation of DNA Ligase 1 by G9a/GLP Recruits UHRF1 to Replicating DNA and Regulates DNA Methylation

Autoren: Laure Ferry, Alexandra Fournier, Takeshi Tsusaka, Guillaume Adelmant, Tadahiro Shimazu, Shohei Matano, Olivier Kirsh, Rachel Amouroux, Naoshi Dohmae, Takehiro Suzuki, Guillaume J. Filion, Wen Deng, Maud de Dieuleveult, Lauriane Fritsch, Srikanth Kudithipudi, Albert Jeltsch, Heinrich Leonhardt, Petra Hajkova, Jarrod A. Marto, Kyohei Arita, Yoichi Shinkai, Pierre-Antoine Defossez
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 67/4, 2017, Seite(n) 550-565.e5, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2017.07.012

Dynamic changes in H1 subtype composition during epigenetic reprogramming

Autoren: Annalisa Izzo, Céline Ziegler-Birling, Peter W.S. Hill, Lydia Brondani, Petra Hajkova, Maria-Elena Torres-Padilla, Robert Schneider
Veröffentlicht in: The Journal of Cell Biology, Ausgabe 216/10, 2017, Seite(n) 3017-3028, ISSN 0021-9525
Herausgeber: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201611012

Evolutionary analysis indicates that DNA alkylation damage is a byproduct of cytosine DNA methyltransferase activity

Autoren: Silvana Rošić, Rachel Amouroux, Cristina E. Requena, Ana Gomes, Max Emperle, Toni Beltran, Jayant K. Rane, Sarah Linnett, Murray E. Selkirk, Philipp H. Schiffer, Allison J. Bancroft, Richard K. Grencis, Albert Jeltsch, Petra Hajkova, Peter Sarkies
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2018, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-018-0061-8

DNA (De)Methylation: The Passive Route to Naïvety?

Autoren: Harry G. Leitch, M. Azim Surani, Petra Hajkova
Veröffentlicht in: Trends in Genetics, Ausgabe 32/10, 2016, Seite(n) 592-595, ISSN 0168-9525
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2016.08.005

Evolutionary Persistence of DNA Methylation for Millions of Years after Ancient Loss of a De Novo Methyltransferase

Autoren: Sandra Catania, Phillip A Dumesic, Harold Pimentel, Ammar Nasif, Caitlin I Stoddard, Jordan E Burke, Jolene K Diedrich, Sophie Cooke, Terrance Shea, Elizabeth Gienger, Robert Lintner, John R Yates III, Petra Hajkova, Geeta J Narlikar, Christina A Cuomo, Jonathan K Pritchard, Hiten D Madhani
Veröffentlicht in: Cell, 2020, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.12.012

Dynamic DNA methylation: In the right place at the right time

Autoren: Chongyuan Luo; Petra Hajkova; Joseph R. Ecker
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 00368075, 2018, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aat6806

Oral vitamin C supplementation to patients with myeloid cancer on azacitidine treatment: Normalization of plasma vitamin C induces epigenetic changes

Autoren: Linn Gillberg, Andreas D Ørskov, Ammar Nasif, Hitoshi Ohtani, Zachary Madaj, Jakob W Hansen, Nicolas Rapin, Johanne B Mogensen, Minmin Liu, Inge H Dufva, Jens Lykkesfeldt, Petra Hajkova, Peter A Jones, Kirsten Grønbæk
Veröffentlicht in: Clinical epigenetics, 2019, ISSN 1868-7075
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1186/s13148-019-0739-5

SLIC-CAGE: high-resolution transcription start site mapping using nanogram-levels of total RNA.

Autoren: Nevena Cvetesic; Harry G. Leitch; Malgorzata Borkowska; Ferenc Müller; Piero Carninci; Petra Hajkova; Boris Lenhard; Boris Lenhard
Veröffentlicht in: Genome Research, Ausgabe 1, 2018, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.235937.118

TBPL2/TFIIA complex establishes the maternal transcriptome through oocyte-specific promoter usage

Autoren: Changwei Yu, Nevena Cvetesic, Vincent Hisler, Kapil Gupta, Tao Ye, Emese Gazdag, Luc Negroni, Petra Hajkova, Imre Berger, Boris Lenhard, Ferenc Müller, Stéphane D Vincent, László Tora
Veröffentlicht in: Nature communications, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20239-4

Sex-specific chromatin remodelling safeguards transcription in germ cells.

Autoren: Tien-Chi Huang, Yi-Fang Wang, Eric Vazquez-Ferrer, Ina Theofel, Cristina E. Requena, Courtney W. Hanna, Gavin Kelsey & Petra Hajkova
Veröffentlicht in: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04208-5

Specification and epigenomic resetting of the pig germline exhibit conservation with the human lineage

Autoren: Qifan Zhu, Fei Sang, Sarah Withey, Walfred Tang, Sabine Dietmann, Doris Klisch, Priscila Ramos-Ibeas, Haixin Zhang, Cristina E Requena, Petra Hajkova, Matt Loose, M Azim Surani, Ramiro Alberio
Veröffentlicht in: Cell Reports, 2021, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2021.108735

TET2 Regulates the Neuroinflammatory Response in Microglia

Autoren: Alejandro Carrillo-Jimenez, Özgen Deniz, Maria Victoria Niklison-Chirou, Rocio Ruiz, Karina Bezerra-Salomao, Vassilis Stratoulias, Rachel Amouroux, Ping Kei Yip, Anna Vilalta, Mathilde Cheray, Alexander Michael Scott-Egerton, Eloy Rivas, Khadija Tayara, Irene García-Domínguez, Juan Garcia-Revilla, Juan Carlos Fernandez-Martin, Ana Maria Espinosa-Oliva, Xianli Shen, Peter St George-Hyslop, Guy C
Veröffentlicht in: Cell Reports, 2019, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.013

Other (1)

Global regulatory transitions at core promoters demarcate the mammalian germline cycle

Autoren: Nevena Cvetesic; Malgorzata Borkowska; Yuki Hatanaka; Harry G. Leitch; Ferenc Müller; Changwei Yu; Stéphane D. Vincent; Laszlo Tora; Petra Hajkova; Boris Lenhard
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2020
Herausgeber: Cold Spring Harbour Laboratory
DOI: 10.1101/2020.10.30.361865