The transcription-related DNA damage response

Informations projet

TRANSDAM

N° de convention de subvention: 693327

DOI

10.3030/693327

Projet clôturé

Date de signature de la CE 27 Juin 2016

Date de début 1 Septembre 2016

Date de fin 28 Février 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 988,00

Contribution de l’UE

€ 2 499 988,00

Coordonné par

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Publications

Peer reviewed articles (17)

Evidence That STK19 Is Not an NRAS-dependent Melanoma Driver

Auteurs: Marta Rodríguez-Martínez, Thierry Boissiére, Melvin Noe Gonzalez, Kevin Litchfield, Richard Mitter, Jane Walker, Svend Kjœr, Mohamed Ismail, Julian Downward, Charles Swanton, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Cell, Numéro 181/6, 2020, Page(s) 1395-1405.e11, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.014

The ASC-1 Complex Disassembles Collided Ribosomes

Auteurs: Szymon Juszkiewicz, Shaun H. Speldewinde, Li Wan, Jesper Q. Svejstrup, Ramanujan S. Hegde
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 79/4, 2020, Page(s) 603-614.e8, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.06.006

Translation stress and collided ribosomes are co-activators of cGAS

Auteurs: Li Wan; Szymon Juszkiewicz; Daniel Blears; Prashanth Kumar Bajpe; Zhong Han; Zhong Han; Peter Faull; Richard Mitter; Aengus Stewart; Ambrosius P. Snijders; Ramanujan S. Hegde; Jesper Q. Svejstrup; Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 2, 2021, ISSN 1097-4164
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.05.018

Regulation of the RNAPII Pool Is Integral to the DNA Damage Response

Auteurs: Ana Tufegdžić Vidaković, Richard Mitter, Gavin P. Kelly, Michelle Neumann, Michelle Harreman, Marta Rodríguez-Martínez, Anna Herlihy, Juston C. Weems, Stefan Boeing, Vesela Encheva, Liam Gaul, Laura Milligan, David Tollervey, Ronald C. Conaway, Joan W. Conaway, Ambrosius P. Snijders, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Cell, Numéro 180/6, 2020, Page(s) 1245-1261.e21, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.02.009

Multiplex Cell Fate Tracking by Flow Cytometry

Auteurs: Marta Rodríguez-Martínez, Stephanie A. Hills, John F. X. Diffley, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Methods and Protocols, Numéro 3/3, 2020, Page(s) 50, ISSN 2409-9279
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/mps3030050

Transcription-coupled repair and the transcriptional response to UV-Irradiation.

Auteurs: Liam Gaul; Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: DNA Repair, Numéro 4, 2021, ISSN 1568-7864
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.dnarep.2021.103208

Annotation matters: validating the discovery of cancer drivers

Auteurs: Marta Rodríguez-Martínez, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Molecular & Cellular Oncology, Numéro 7/6, 2020, Page(s) 1806679, ISSN 2372-3556
Éditeur: Taylor and Francis
DOI: 10.1080/23723556.2020.1806679

CDK13 cooperates with CDK12 to control global RNA polymerase II processivity

Auteurs: Zheng Fan, Jennifer R. Devlin, Simon J. Hogg, Maria A. Doyle, Paul F. Harrison, Izabela Todorovski, Leonie A. Cluse, Deborah A. Knight, Jarrod J. Sandow, Gareth Gregory, Andrew Fox, Traude H. Beilharz, Nicholas Kwiatkowski, Nichollas E. Scott, Ana Tufegdzic Vidakovic, Gavin P. Kelly, Jesper Q. Svejstrup, Matthias Geyer, Nathanael S. Gray, Stephin J. Vervoort, Ricky W. Johnstone
Publié dans: Science Advances, Numéro 6/18, 2020, Page(s) eaaz5041, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.aaz5041

Cockayne syndrome B protein regulates recruitment of the Elongin A ubiquitin ligase to sites of DNA damage

Auteurs: Juston C. Weems, Brian D. Slaughter, Jay R. Unruh, Stefan Boeing, Shawn M. Hall, Merry B. McLaird, Takashi Yasukawa, Teijiro Aso, Jesper Q. Svejstrup, Joan W. Conaway, Ronald C. Conaway
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 292/16, 2017, Page(s) 6431-6437, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.C117.777946

UV Irradiation Induces a Non-coding RNA that Functionally Opposes the Protein Encoded by the Same Gene

Auteurs: Laura Williamson, Marco Saponaro, Stefan Boeing, Philip East, Richard Mitter, Theodoros Kantidakis, Gavin P. Kelly, Anna Lobley, Jane Walker, Bradley Spencer-Dene, Michael Howell, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Cell, Numéro 168/5, 2017, Page(s) 843-855.e13, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2017.01.019

The Cellular Response to Transcription-Blocking DNA Damage

Auteurs: Lea H. Gregersen, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Trends in Biochemical Sciences, Numéro 43/5, 2018, Page(s) 327-341, ISSN 0968-0004
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibs.2018.02.010

A Ubiquitin-Binding Domain that Binds a Structural Fold Distinct from that of Ubiquitin

Auteurs: Michael Lim, Joseph A. Newman, Hannah L. Williams, Laura Masino, Hazel Aitkenhead, Angeline E. Gravard, Opher Gileadi, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Structure, Numéro 27/8, 2019, Page(s) 1316-1325.e6, ISSN 2352-0124
Éditeur: Elsevier Limited

Genome-wide reconstitution of chromatin transactions reveals that RSC preferentially disrupts H2AZ-containing nucleosomes

Auteurs: Aylin Cakiroglu, Cedric R. Clapier, Andreas H. Ehrensberger, Elodie Darbo, Bradley R. Cairns, Nicholas M. Luscombe, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Genome Research, Numéro 29/6, 2019, Page(s) 988-998, ISSN 1088-9051
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.243139.118

SCAF4 and SCAF8, mRNA Anti-Terminator Proteins

Auteurs: Lea H. Gregersen, Richard Mitter, Alejandro P. Ugalde, Takayuki Nojima, Nicholas J. Proudfoot, Reuven Agami, Aengus Stewart, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Cell, Numéro 177/7, 2019, Page(s) 1797-1813.e18, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.04.038

Elongation Factor TFIIS Prevents Transcription Stress and R-Loop Accumulation to Maintain Genome Stability

Auteurs: Diana Zatreanu, Zhong Han, Richard Mitter, Emanuela Tumini, Hannah Williams, Lea Gregersen, A. Barbara Dirac-Svejstrup, Stefania Roma, Aengus Stewart, Andres Aguilera, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 76/1, 2019, Page(s) 57-69.e9, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.07.037

Analysis of RNA polymerase II ubiquitylation and proteasomal degradation

Auteurs: Ana Tufegdzic Vidakovic, Michelle Harreman, A. Barbara Dirac-Svejstrup, Stefan Boeing, Anindya Roy, Vesela Encheva, Michelle Neumann, Marcus Wilson, Ambrosius P. Snijders, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Methods, Numéro 159-160, 2019, Page(s) 146-156, ISSN 1046-2023
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymeth.2019.02.005

DDI2 Is a Ubiquitin-Directed Endoprotease Responsible for Cleavage of Transcription Factor NRF1

Auteurs: A. Barbara Dirac-Svejstrup, Jane Walker, Peter Faull, Vesela Encheva, Vyacheslav Akimov, Michele Puglia, David Perkins, Sandra Kümper, Suchete S. Hunjan, Blagoy Blagoev, Ambrosius P. Snijders, David J. Powell, Jesper Q. Svejstrup
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 79/2, 2020, Page(s) 332-341.e7, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.05.035